178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0268 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  72.81 
 
 		 228 aa  346  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  63.81 
 
 		 221 aa  269  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  56.74 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1276  cytochrome B561  57.8 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0285  cytochrome B561  57.14 
 
 		 222 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0260456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0290  cytochrome B561  56.68 
 
 		 222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0403  cytochrome B561  58.6 
 
 		 252 aa  208  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  43.75 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  41.07 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  46.2 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  45.21 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  43.32 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  39.52 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  38.83 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  39.13 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  40.54 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  38.6 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  40.61 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  31.48 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  40.61 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  40.61 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  40.1 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2745  cytochrome B561  41.46 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  36.19 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  35.29 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49100  Nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  42.19 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1074  cytochrome B561  39.07 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0236841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  40.89 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  35.53 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  42.93 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  39.36 
 
 		 199 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  39.36 
 
 		 199 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  42.02 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  35.65 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  35.65 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  35.65 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  35.19 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3421  b-type cytochrome, putative  38.91 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0900  b-type cytochrome, putative  38.31 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.983268  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3588  cytochrome B561  40.54 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0590  cytochrome B561  45.41 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  40 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  40.66 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  42.55 
 
 		 193 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  37.37 
 
 		 241 aa  111  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2558  cytochrome B561  38.27 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.952608  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  34.44 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  35.27 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  31.74 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  30.56 
 
 		 387 aa  98.2  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  33.7 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  30.97 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  40.83 
 
 		 349 aa  95.1  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2690  cytochrome B561  37.79 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  34.98 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  34.98 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  34.41 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  34.98 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  34.98 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  32.79 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  38.1 
 
 		 236 aa  92  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  31.68 
 
 		 229 aa  91.7  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  39.13 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  33.96 
 
 		 195 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  37.02 
 
 		 363 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  37.02 
 
 		 363 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  33.7 
 
 		 184 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  31.47 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  33.33 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  31.03 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  29.12 
 
 		 187 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  30.39 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  30.54 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0316  cytochrome B561  32.24 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  32.97 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  32.12 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  37.7 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  32.78 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2214  cytochrome B561  25.21 
 
 		 247 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312058  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  28.42 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  33.16 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2317  cytochrome B561  27.16 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0816161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2387  cytochrome B561  27.16 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.549561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  30 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  28.86 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  34.69 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  34.69 
 
 		 190 aa  72  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1304  putative cytochrome b561 family protein  30.77 
 
 		 255 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  32.98 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2510  cytochrome B561  27.16 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  hitchhiker  0.00000518904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  30.28 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3509  cytochrome B561  28.27 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  26.78 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  27.08 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2692  cytochrome B561  26.18 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000585757  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06855  cytochrome b  41.07 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2726  cytochrome b, putative  29.52 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  33.08 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1787  cytochrome B561  32.21 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>