178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6334 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  100 
 
 
242 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  62.14 
 
 
243 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  56.25 
 
 
245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  53 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  51.22 
 
 
349 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  55.61 
 
 
245 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  54.46 
 
 
236 aa  206  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  47.19 
 
 
212 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  48.48 
 
 
201 aa  171  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  39.35 
 
 
387 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  41.33 
 
 
239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  43.24 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  41.76 
 
 
198 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  35.14 
 
 
229 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  41.76 
 
 
198 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  41.76 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  40.11 
 
 
198 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1534  cytochrome B561  37.4 
 
 
254 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  41.08 
 
 
187 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  43.5 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  40.09 
 
 
229 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  39.18 
 
 
210 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  41.53 
 
 
195 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  44.05 
 
 
181 aa  128  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  41.53 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  41.53 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  42.08 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  41.53 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  39.41 
 
 
195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  34.11 
 
 
214 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  42.47 
 
 
184 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  41.8 
 
 
203 aa  121  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  36.15 
 
 
218 aa  121  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  39.78 
 
 
204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  38.76 
 
 
179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  37.89 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  41.38 
 
 
202 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  31.75 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  34.22 
 
 
265 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  41.9 
 
 
190 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1491  cytochrome B561  44.05 
 
 
182 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.268011 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  43.35 
 
 
175 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2807  putative cytochrome b  43.45 
 
 
212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  41.34 
 
 
190 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  37.07 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  32.8 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  31.11 
 
 
231 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  35.94 
 
 
219 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  32.24 
 
 
226 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2690  cytochrome B561  39.46 
 
 
221 aa  105  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  39.76 
 
 
177 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5695  putative cytochrome b561 family protein  39.05 
 
 
193 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  33.16 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1811  cytochrome B561  41.67 
 
 
184 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0316  cytochrome B561  32.8 
 
 
191 aa  97.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  33.16 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  34.88 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1074  cytochrome B561  32.48 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0236841  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  30.15 
 
 
236 aa  96.3  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1304  putative cytochrome b561 family protein  34.97 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  32.81 
 
 
226 aa  95.9  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  34.41 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  32.97 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  32.42 
 
 
222 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  34.02 
 
 
199 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  37.5 
 
 
178 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1227  cytochrome B561  34.13 
 
 
175 aa  93.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  34.02 
 
 
199 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  36.17 
 
 
227 aa  93.2  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2745  cytochrome B561  30.3 
 
 
231 aa  92.8  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4949  cytochrome B561  37.36 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  32.22 
 
 
230 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  32.22 
 
 
230 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  31.35 
 
 
230 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  32.22 
 
 
230 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  33.88 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  29.63 
 
 
221 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  29.89 
 
 
222 aa  89.7  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  36.07 
 
 
363 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  32.42 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1276  cytochrome B561  30.81 
 
 
225 aa  89.4  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0590  cytochrome B561  34.67 
 
 
266 aa  88.6  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  36.61 
 
 
363 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1896  cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 
181 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.832729  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  30.43 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3588  cytochrome B561  32.14 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3509  cytochrome B561  33.93 
 
 
181 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  26.86 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1933  cytochrome B561  41.57 
 
 
185 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  26.86 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4627  cytochrome B561  38.24 
 
 
172 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.176901  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  33.88 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  33.51 
 
 
198 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  30.5 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0900  b-type cytochrome, putative  31.88 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.983268  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10120  cytochrome b561 family protein  37.85 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220125  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2214  cytochrome B561  26.24 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312058  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  25.93 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  35.45 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0655  hypothetical protein  35.54 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>