185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1787 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1787  cytochrome B561  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2491  cytochrome B561  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1795  cytochrome B561  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1831  cytochrome B561  98.79 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2317  cytochrome B561  80.65 
 
 		 248 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0816161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2387  cytochrome B561  80.65 
 
 		 248 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.549561  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2726  cytochrome b, putative  79.84 
 
 		 248 aa  425  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2510  cytochrome B561  81.85 
 
 		 248 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  hitchhiker  0.00000518904 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2692  cytochrome B561  57.32 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000585757  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2214  cytochrome B561  55.65 
 
 		 247 aa  294  8e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312058  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2388  cytochrome b561  57.02 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2729  cytochrome B561  53.82 
 
 		 246 aa  265  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1941  cytochrome b561 family protein  40.17 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00760577  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  31.72 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  29.07 
 
 		 214 aa  88.6  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  29.03 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  27.59 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  27.49 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  31.62 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  29.41 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  27.63 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  29.82 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  31.25 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  27.73 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  33.33 
 
 		 179 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  31.85 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  31.11 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  34.06 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0874  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.82 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  26.97 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  28.7 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  31.93 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  28.88 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  28.82 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3330  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  27.16 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  26.64 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  28.99 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1074  cytochrome B561  32.74 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0236841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  30.12 
 
 		 178 aa  72  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  26.03 
 
 		 202 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3987  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  25.4 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  28.1 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  29.06 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2054  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.74 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  27.07 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  28.45 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  28.57 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  27.75 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  23.18 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  31.72 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2058  cytochrome B561  27.39 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  28.82 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  25.78 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0173  cytochrome B561  27.39 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.551563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  30.47 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  26.34 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0121  nickel-iron hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.68 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.347229  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  29.09 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  29.93 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3146  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.64 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0114554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1156  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  21.65 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  27.07 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  32.21 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1164  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  21.48 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7263  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.11 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73881  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4949  cytochrome B561  28.38 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0543  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.11 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  25.41 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2130  cytochrome B561  24.18 
 
 		 390 aa  67  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.578698  normal  0.698297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  26.67 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  25.71 
 
 		 199 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1295  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  25.1 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00118042  normal  0.526274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  25.71 
 
 		 199 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3770  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  20.87 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2321  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.77 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  27.59 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  28.08 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  30.34 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  30.34 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  30.34 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  30.34 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2745  cytochrome B561  29.82 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2429  [Ni/Fe] hydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  26.52 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943103  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  25.45 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  25.89 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1972  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.3 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.184335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  30 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  30.97 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  30.72 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  27.43 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  25.31 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  24.9 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  29.69 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  25.11 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2175  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.18 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000847396  normal  0.136379 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  27.39 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  24.89 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0900  b-type cytochrome, putative  27.68 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.983268  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1276  cytochrome B561  29.33 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  24.12 
 
 		 177 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>