130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3509 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3509  cytochrome B561  100 
 
 		 181 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1896  cytochrome b561 family protein  89.5 
 
 		 181 aa  330  8e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.832729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4627  cytochrome B561  66.07 
 
 		 172 aa  223  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.176901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10120  cytochrome b561 family protein  64.16 
 
 		 175 aa  214  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220125  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  43.53 
 
 		 202 aa  141  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  42.77 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1227  cytochrome B561  41.21 
 
 		 175 aa  135  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  40.83 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  40.83 
 
 		 202 aa  131  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  41.86 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  40.24 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  40.96 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  40.11 
 
 		 184 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4949  cytochrome B561  43.2 
 
 		 207 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1491  cytochrome B561  39.41 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.268011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  42.37 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2807  putative cytochrome b  39.41 
 
 		 212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  35.5 
 
 		 182 aa  117  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  43.71 
 
 		 178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  31.96 
 
 		 198 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  34.92 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  33.33 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  31.44 
 
 		 198 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  30.41 
 
 		 198 aa  100  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  35.06 
 
 		 243 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  30.05 
 
 		 198 aa  98.6  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1933  cytochrome B561  43.79 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  33.52 
 
 		 212 aa  97.4  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  33.14 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03472  Cytochrome b561 family protein  32.42 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  30.98 
 
 		 210 aa  95.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  32.96 
 
 		 228 aa  94  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  29.81 
 
 		 218 aa  93.6  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  30.81 
 
 		 229 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1811  cytochrome B561  34.66 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0655  hypothetical protein  36.64 
 
 		 178 aa  92.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  35.45 
 
 		 363 aa  90.9  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  30.85 
 
 		 195 aa  90.9  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  30.85 
 
 		 195 aa  90.9  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  30.85 
 
 		 195 aa  90.9  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  30.85 
 
 		 195 aa  90.9  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  31.32 
 
 		 199 aa  90.9  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  31.32 
 
 		 199 aa  90.9  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  30.32 
 
 		 195 aa  90.1  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  34.48 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  35.45 
 
 		 363 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  32.54 
 
 		 239 aa  89  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  34.68 
 
 		 190 aa  88.6  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  36.21 
 
 		 245 aa  87.8  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  30.93 
 
 		 203 aa  87.8  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  28.65 
 
 		 387 aa  85.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  35.84 
 
 		 236 aa  84.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  32.62 
 
 		 226 aa  84.3  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  36.21 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  32.42 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  33.33 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  26.76 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  32.24 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  35.63 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  26.04 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  26.82 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1534  cytochrome B561  30.11 
 
 		 254 aa  78.2  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  29.67 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0285  cytochrome B561  37.6 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0260456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0290  cytochrome B561  37.6 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341868 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  25.4 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  33.93 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  25.81 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1276  cytochrome B561  29.73 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  25.6 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  26.2 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  27.72 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  26.6 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2690  cytochrome B561  28.65 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0316  cytochrome B561  28.57 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  26.97 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  28.96 
 
 		 231 aa  67  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  25.41 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1304  putative cytochrome b561 family protein  28.49 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  29.84 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  28.88 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5695  putative cytochrome b561 family protein  30.95 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  30.48 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  26.56 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  27.37 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2558  cytochrome B561  27.18 
 
 		 224 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.952608  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  24.34 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  24.6 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  25 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  27.47 
 
 		 219 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2388  cytochrome b561  25 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  23.33 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  21.43 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1795  cytochrome B561  26.6 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2491  cytochrome B561  26.6 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1787  cytochrome B561  26.6 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2510  cytochrome B561  22.88 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  hitchhiker  0.00000518904 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2692  cytochrome B561  22.32 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000585757  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0403  cytochrome B561  29.85 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  23.5 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>