108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03472 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03472  Cytochrome b561 family protein  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  31.75 
 
 		 179 aa  111  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  33.15 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  32.77 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1227  cytochrome B561  33.33 
 
 		 175 aa  101  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  32.07 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1896  cytochrome b561 family protein  32.58 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.832729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3509  cytochrome B561  32.42 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  30.6 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10120  cytochrome b561 family protein  31.28 
 
 		 175 aa  89  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220125  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  27.62 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  29.89 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0655  hypothetical protein  32.64 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  26.92 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4627  cytochrome B561  28.49 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.176901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  26.52 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  27.81 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  27.07 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  27.94 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  30.77 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  26.91 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  26.7 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  25.7 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  27.07 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1933  cytochrome B561  32.24 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4949  cytochrome B561  26.92 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  25.76 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  29.32 
 
 		 226 aa  67.8  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  27.47 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  26.06 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  26.74 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  27.68 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  24.61 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  24.74 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  23.44 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  26.32 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  25.87 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  25 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  26.24 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  25.37 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1811  cytochrome B561  26.49 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  26.37 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  23.38 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  23.38 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  24.75 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  24.87 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  31.32 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1491  cytochrome B561  26.32 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.268011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5695  putative cytochrome b561 family protein  25.56 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2807  putative cytochrome b  26.4 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  24.21 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  24.87 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  28.8 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  24.86 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  25.13 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  24.87 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  24.87 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  26.13 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  24.87 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  24.87 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  25.63 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  25.63 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  25.63 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  22.34 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  25.63 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  27.72 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  22.62 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  26.36 
 
 		 349 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2745  cytochrome B561  26.73 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1304  putative cytochrome b561 family protein  23.94 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  28.12 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  25.79 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  24.73 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0900  b-type cytochrome, putative  26.06 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.983268  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  26.04 
 
 		 231 aa  51.6  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2690  cytochrome B561  25.65 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  24.02 
 
 		 387 aa  50.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  24.08 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  24.48 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  23.04 
 
 		 241 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  24.35 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  25.4 
 
 		 245 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0290  cytochrome B561  27.15 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0285  cytochrome B561  27.15 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0260456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  25 
 
 		 229 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  25 
 
 		 229 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  27.22 
 
 		 236 aa  48.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  25 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  26.13 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3987  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  25 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1534  cytochrome B561  23.08 
 
 		 254 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  22.81 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  21.93 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  26.9 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  23.56 
 
 		 365 aa  46.2  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0590  cytochrome B561  26.18 
 
 		 266 aa  45.1  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3421  b-type cytochrome, putative  23.81 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3369  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.23 
 
 		 240 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00901378  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0316  cytochrome B561  23.76 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3444  cytochrome b561 family protein  24.35 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>