159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1211 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  100 
 
 		 178 aa  361  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  62.64 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1933  cytochrome B561  71.01 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  45.51 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  42.31 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  44.77 
 
 		 184 aa  150  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  49.7 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1227  cytochrome B561  40.12 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  46.75 
 
 		 204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  44.19 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  40.83 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10120  cytochrome b561 family protein  43.79 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220125  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4949  cytochrome B561  44.38 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1896  cytochrome b561 family protein  44.31 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.832729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3509  cytochrome B561  43.71 
 
 		 181 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4627  cytochrome B561  43.53 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.176901  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  41.71 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  44.05 
 
 		 177 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  41.07 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  43.43 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  45.24 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  44.91 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0655  hypothetical protein  35.76 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  37.77 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  39.23 
 
 		 192 aa  117  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  37.04 
 
 		 198 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1491  cytochrome B561  43.35 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.268011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  37.23 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  37.23 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  37.23 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  37.23 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2807  putative cytochrome b  43.2 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  35.98 
 
 		 198 aa  114  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  34.95 
 
 		 198 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  38.25 
 
 		 203 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  35.45 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  38.46 
 
 		 243 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5695  putative cytochrome b561 family protein  35.96 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  35.2 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  34.44 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  36.67 
 
 		 229 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03472  Cytochrome b561 family protein  30.6 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  35.71 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  36.67 
 
 		 226 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  33.33 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  38.07 
 
 		 237 aa  100  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  37.08 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  40 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1811  cytochrome B561  36.47 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  33.49 
 
 		 214 aa  99  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2690  cytochrome B561  37.78 
 
 		 221 aa  97.8  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  37.5 
 
 		 242 aa  97.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  39.47 
 
 		 363 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  39.47 
 
 		 363 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  30.7 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  34.25 
 
 		 241 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  32.96 
 
 		 387 aa  95.5  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  34.81 
 
 		 231 aa  95.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1304  putative cytochrome b561 family protein  31.07 
 
 		 255 aa  94.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  30.9 
 
 		 222 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  36.21 
 
 		 245 aa  92.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  32.49 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  30.77 
 
 		 222 aa  92.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  32.43 
 
 		 265 aa  92.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  32.49 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  32.58 
 
 		 222 aa  92  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  35.16 
 
 		 219 aa  91.7  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0285  cytochrome B561  38.89 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0260456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0290  cytochrome B561  38.89 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341868 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  37.22 
 
 		 236 aa  89.4  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  33.87 
 
 		 241 aa  89  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  33.72 
 
 		 349 aa  88.2  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  33.33 
 
 		 198 aa  87.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  32.02 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  34.27 
 
 		 245 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  30.9 
 
 		 230 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1276  cytochrome B561  34.62 
 
 		 225 aa  84.7  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  36.97 
 
 		 230 aa  84.7  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  30.9 
 
 		 230 aa  84.3  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  30.9 
 
 		 230 aa  84.3  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2491  cytochrome B561  30.12 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1795  cytochrome B561  30.12 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1787  cytochrome B561  30.12 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2214  cytochrome B561  34.56 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312058  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  33.53 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  28.41 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2317  cytochrome B561  28.33 
 
 		 248 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0816161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2387  cytochrome B561  28.33 
 
 		 248 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.549561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0900  b-type cytochrome, putative  33.71 
 
 		 222 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.983268  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  34.46 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  33.15 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  30.34 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  32.8 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  30.39 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2388  cytochrome b561  36.43 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  34.45 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  34.45 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  34.45 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1534  cytochrome B561  29.28 
 
 		 254 aa  77.4  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3421  b-type cytochrome, putative  35.29 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>