129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1227 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1227  cytochrome B561  100 
 
 		 175 aa  357  4e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  37.35 
 
 		 179 aa  138  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0655  hypothetical protein  41.04 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10120  cytochrome b561 family protein  44.31 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3509  cytochrome B561  41.21 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  38.46 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  40.46 
 
 		 202 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  38.73 
 
 		 202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  42.26 
 
 		 204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1896  cytochrome b561 family protein  40 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.832729  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4949  cytochrome B561  41.67 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  37.87 
 
 		 175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  37.13 
 
 		 187 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  38.41 
 
 		 195 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  40.12 
 
 		 178 aa  127  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4627  cytochrome B561  38.79 
 
 		 172 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.176901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  37.28 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  37.2 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1933  cytochrome B561  43.21 
 
 		 185 aa  117  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  36.76 
 
 		 198 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  34.58 
 
 		 214 aa  117  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1491  cytochrome B561  40.48 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.268011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  36.46 
 
 		 192 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  36.22 
 
 		 198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2807  putative cytochrome b  39.88 
 
 		 212 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  36.36 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  35.33 
 
 		 198 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  37.13 
 
 		 243 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  36.11 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  35.14 
 
 		 226 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  35.14 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  32.86 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  32.95 
 
 		 212 aa  103  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  37.43 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  37.43 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  37.43 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  37.43 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  37.43 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03472  Cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  38.6 
 
 		 201 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  35.23 
 
 		 229 aa  99  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  34.76 
 
 		 190 aa  97.4  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  31.91 
 
 		 228 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  34.76 
 
 		 190 aa  95.5  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  32.35 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  32.4 
 
 		 199 aa  94.4  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  32.4 
 
 		 199 aa  94.4  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  34.83 
 
 		 203 aa  93.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  35.67 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  32.43 
 
 		 219 aa  92.4  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  30.17 
 
 		 237 aa  91.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1811  cytochrome B561  31.36 
 
 		 184 aa  90.9  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  33 
 
 		 222 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  34.64 
 
 		 198 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5695  putative cytochrome b561 family protein  33.94 
 
 		 193 aa  87.8  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  32.96 
 
 		 226 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  30.11 
 
 		 229 aa  84  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  33.33 
 
 		 245 aa  84.3  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  29.63 
 
 		 265 aa  84  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  34.13 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  30 
 
 		 387 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  31.21 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  36.87 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  36.87 
 
 		 363 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  31.43 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  31.43 
 
 		 349 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  29.1 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  25.41 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  29.26 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0290  cytochrome B561  35.16 
 
 		 222 aa  74.3  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0285  cytochrome B561  36.07 
 
 		 222 aa  74.3  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0260456  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  28.65 
 
 		 193 aa  72  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0900  b-type cytochrome, putative  31.49 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.983268  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  28.73 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  30 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  30.73 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2745  cytochrome B561  33.52 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  28.98 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  30.68 
 
 		 231 aa  67  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  33.15 
 
 		 219 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  26.98 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0316  cytochrome B561  31.32 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  28.98 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1304  putative cytochrome b561 family protein  26.22 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3421  b-type cytochrome, putative  31.62 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  34.19 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  34.19 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  29.94 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  34.19 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  28.41 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  28.41 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1534  cytochrome B561  27.75 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  27.87 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2690  cytochrome B561  31.84 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1276  cytochrome B561  32.79 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  26.74 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0590  cytochrome B561  31.84 
 
 		 266 aa  62  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3449  hypothetical protein  35.56 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  0.279957 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1074  cytochrome B561  30.83 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0236841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  28.78 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>