180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2214 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2214  cytochrome B561  100 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312058  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2388  cytochrome b561  71.49 
 
 		 255 aa  353  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2692  cytochrome B561  59.67 
 
 		 261 aa  315  6e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000585757  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2729  cytochrome B561  61.6 
 
 		 246 aa  310  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2317  cytochrome B561  56.05 
 
 		 248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0816161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2387  cytochrome B561  56.05 
 
 		 248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.549561  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2726  cytochrome b, putative  53.04 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2510  cytochrome B561  56.68 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  hitchhiker  0.00000518904 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2491  cytochrome B561  55.87 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1831  cytochrome B561  55.47 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1787  cytochrome B561  55.87 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1795  cytochrome B561  55.87 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1941  cytochrome b561 family protein  38.79 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00760577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  31.14 
 
 		 214 aa  92  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  29.96 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  25.73 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  29.2 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  27.16 
 
 		 387 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  30.4 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  33.09 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  27.43 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  27.54 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  30.77 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  28.75 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  24.57 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  28.63 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  29.2 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  25.86 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  24.89 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  27.19 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  28.32 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  29.52 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  27.35 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  26.67 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  32 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  25.54 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  29.46 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  28.45 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  27.48 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  34.29 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1276  cytochrome B561  30.26 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  32.68 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  27.51 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  27.68 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  24.15 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  26.32 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  26.32 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  26.96 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  25.88 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  32 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1074  cytochrome B561  34.06 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0236841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  26.41 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  29.18 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  29.18 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  29.18 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  29.18 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  32.88 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  30.4 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  27.16 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  32.45 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0285  cytochrome B561  27.04 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0260456  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  33.33 
 
 		 193 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  32 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  34.81 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0290  cytochrome B561  27.04 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  32 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  31.01 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  31.01 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  27.03 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  31.01 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  34.56 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  31.33 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  31.33 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  26.72 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  25.43 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  25.22 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  28.82 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  29.6 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  27.16 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3588  cytochrome B561  31.58 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  24.55 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  25.78 
 
 		 187 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  28.07 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  27.35 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0874  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.15 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  25.43 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  30.37 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1998  Ni/Fe-hydrogenase, 1 b-type cytochrome subunit  25.41 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0900  b-type cytochrome, putative  28.12 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.983268  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3770  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  22.63 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4949  cytochrome B561  31.39 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0543  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.31 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  24.14 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1163  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  23.92 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1295  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  22.76 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00118042  normal  0.526274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1156  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  21.16 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  22.07 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  26.99 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2054  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.67 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5695  putative cytochrome b561 family protein  25.33 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.510651 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>