179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1301 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  100 
 
 		 387 aa  797    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  35.39 
 
 		 365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  26.63 
 
 		 387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  26.88 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  26.61 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  30.37 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  29.47 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  35.43 
 
 		 161 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  32.56 
 
 		 188 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  34.65 
 
 		 170 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  26.2 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  27.2 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  32.48 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  24.02 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  26.32 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  29.73 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  25.73 
 
 		 202 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  24.31 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  27.51 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  27.51 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  26.84 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  28.11 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  27.31 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  28.88 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  30.5 
 
 		 163 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  30.3 
 
 		 160 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  26.48 
 
 		 218 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  24.62 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  26.42 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  28.72 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  28.42 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  33.86 
 
 		 173 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  32.58 
 
 		 162 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  26.63 
 
 		 245 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  28.05 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  28.12 
 
 		 168 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  25.53 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  27.64 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5695  putative cytochrome b561 family protein  25.65 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  26.34 
 
 		 198 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  26.74 
 
 		 198 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  27.46 
 
 		 226 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  27.91 
 
 		 177 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  26.11 
 
 		 160 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  24.37 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  24.19 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  26.46 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  25.76 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  27.27 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  26.92 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  30.48 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  27.68 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  27.68 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  26.63 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  28.14 
 
 		 187 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  27.92 
 
 		 226 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  26.53 
 
 		 230 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  27.23 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  24.88 
 
 		 241 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1860  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.17 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  25.48 
 
 		 190 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1534  cytochrome B561  20.59 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  23.62 
 
 		 184 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  29.17 
 
 		 168 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  26.53 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  22.01 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  26.53 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3369  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.22 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00901378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1406  cytochrome B561  28.12 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1811  cytochrome B561  22.92 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  28.06 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  21.33 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  22.95 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  25.5 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  23.81 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  22.77 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  27.68 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  25.11 
 
 		 221 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2388  cytochrome b561  22.8 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2807  putative cytochrome b  23.86 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  28.46 
 
 		 168 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1491  cytochrome B561  24.37 
 
 		 182 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.268011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  29.58 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  27.84 
 
 		 195 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49100  Nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.51 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  24.3 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0316  cytochrome B561  31.65 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  26.09 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4949  cytochrome B561  27.67 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3183  diheme cytochrome c  26.87 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03472  Cytochrome b561 family protein  25.73 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  23.12 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  23.12 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  28.46 
 
 		 148 aa  57  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1941  cytochrome b561 family protein  24.68 
 
 		 239 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00760577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  26.32 
 
 		 221 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  28.12 
 
 		 230 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  27.4 
 
 		 187 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  27.4 
 
 		 187 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0336  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.15 
 
 		 244 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00129504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>