35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1924 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  100 
 
 
163 aa  335  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  51.94 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  51.94 
 
 
161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  48.51 
 
 
177 aa  124  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3183  diheme cytochrome c  44.03 
 
 
162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  39.62 
 
 
187 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  38.99 
 
 
187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  39.88 
 
 
183 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  38.99 
 
 
187 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  39.88 
 
 
183 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  38.36 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  39.62 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  39.62 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  39.62 
 
 
187 aa  111  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  44.17 
 
 
387 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  40.58 
 
 
173 aa  100  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  40.28 
 
 
168 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  42.74 
 
 
162 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  43.55 
 
 
160 aa  97.4  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  34.62 
 
 
191 aa  96.3  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  42.19 
 
 
363 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  35.97 
 
 
188 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  37.61 
 
 
365 aa  95.5  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  41.41 
 
 
363 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  42.15 
 
 
153 aa  94.4  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  33.59 
 
 
168 aa  93.6  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  35.8 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  36.29 
 
 
186 aa  87  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  37.91 
 
 
168 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  37.16 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1765  diheme cytochrome c  39.83 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.230573  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  36.57 
 
 
192 aa  80.9  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  30.5 
 
 
387 aa  72.4  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0587  hypothetical protein  38 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147983  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2239  hypothetical protein  24.71 
 
 
171 aa  41.2  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0136177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>