40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2020 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  100 
 
 		 161 aa  327  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  94.63 
 
 		 170 aa  286  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  51.94 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  40.96 
 
 		 187 aa  120  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  40.96 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  41.57 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3183  diheme cytochrome c  47.06 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  40 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  40 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  37.8 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  39.63 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  38.99 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  39.63 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  38.18 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  40.14 
 
 		 188 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  44.96 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  42.96 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  36.9 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  40.13 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  38.27 
 
 		 162 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  44.53 
 
 		 363 aa  95.5  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  44.53 
 
 		 363 aa  95.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  38.52 
 
 		 387 aa  94.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  37.07 
 
 		 365 aa  90.5  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  38.93 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  32.81 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  35.37 
 
 		 191 aa  88.6  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1765  diheme cytochrome c  39.83 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.230573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  35.43 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  38.06 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  39.17 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  38.06 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  30.95 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0587  hypothetical protein  29.13 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4636  hypothetical protein  27.93 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2123  hypothetical protein  27.83 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3268  diheme cytochrome c  24.56 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.333963  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4030  putative low-redox potential cytochrome  24.32 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1370  putative low-redox potential cytochrome  25.61 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1400  hypothetical protein  25.61 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>