36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0454 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  100 
 
 		 168 aa  348  2e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  33.55 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  33.55 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  34.75 
 
 		 183 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  34.04 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  34.04 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  33.33 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  33.33 
 
 		 187 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  33.33 
 
 		 187 aa  101  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  34.06 
 
 		 188 aa  98.2  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 191 aa  95.5  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  32.62 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  32.03 
 
 		 168 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  33.59 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  31.85 
 
 		 387 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  37.4 
 
 		 365 aa  92.4  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  34.62 
 
 		 153 aa  92.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  31.85 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  32.81 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  33.08 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1765  diheme cytochrome c  36.15 
 
 		 129 aa  87.8  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.230573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  31.25 
 
 		 170 aa  87.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  29.79 
 
 		 363 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  30 
 
 		 162 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  29.08 
 
 		 363 aa  84.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  26.32 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  31.85 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  28.77 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  29.01 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3183  diheme cytochrome c  27.82 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  29.77 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  26.87 
 
 		 192 aa  62  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  29.17 
 
 		 387 aa  61.6  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0587  hypothetical protein  25.19 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2239  hypothetical protein  24.41 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0136177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4030  putative low-redox potential cytochrome  24.8 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>