35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2239 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2239  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  349  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0136177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2123  hypothetical protein  46.58 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3268  diheme cytochrome c  42.5 
 
 		 178 aa  140  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.333963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0587  hypothetical protein  44.27 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4636  hypothetical protein  43.31 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1370  putative low-redox potential cytochrome  38.65 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1400  hypothetical protein  38.65 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4030  putative low-redox potential cytochrome  38.3 
 
 		 200 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  28.82 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  26.99 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  27.78 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  29.2 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  26.72 
 
 		 192 aa  51.2  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  27.43 
 
 		 173 aa  51.2  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  28.32 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  25.29 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  24.39 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  25 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  24.57 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  23.08 
 
 		 387 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  25.95 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1765  diheme cytochrome c  25.83 
 
 		 129 aa  44.7  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.230573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  25.81 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  25.95 
 
 		 187 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  25.95 
 
 		 187 aa  44.3  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  24.41 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  26.02 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  24.39 
 
 		 187 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  23.58 
 
 		 183 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  23.58 
 
 		 183 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  23.58 
 
 		 187 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  23.58 
 
 		 187 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  25.64 
 
 		 387 aa  41.6  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  24.71 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  26.09 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>