39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0242 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  100 
 
 		 187 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  98.93 
 
 		 187 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  96.26 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  87.7 
 
 		 187 aa  350  5e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  82.89 
 
 		 187 aa  340  5.999999999999999e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  83.42 
 
 		 187 aa  339  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  83.42 
 
 		 187 aa  339  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  83.96 
 
 		 183 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  83.42 
 
 		 183 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  35.9 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  38.99 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  41.67 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  46.67 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  39.1 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  37.97 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  33.33 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  40.91 
 
 		 160 aa  97.8  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  39.26 
 
 		 148 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  34.05 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  35.09 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  35.29 
 
 		 160 aa  95.5  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  36.09 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  36.8 
 
 		 363 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  36.57 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  36.8 
 
 		 363 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  30.05 
 
 		 365 aa  90.9  9e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  37.5 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  34.48 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  35.25 
 
 		 387 aa  88.2  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3183  diheme cytochrome c  36.2 
 
 		 162 aa  87.8  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1765  diheme cytochrome c  37.98 
 
 		 129 aa  86.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.230573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  27.4 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0587  hypothetical protein  30.47 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4030  putative low-redox potential cytochrome  25.19 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1370  putative low-redox potential cytochrome  33.33 
 
 		 177 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1400  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2239  hypothetical protein  25.95 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0136177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4636  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>