25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4636 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4636  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  369  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3268  diheme cytochrome c  42.77 
 
 
178 aa  157  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.333963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2123  hypothetical protein  43.75 
 
 
180 aa  157  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0587  hypothetical protein  37.78 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147983  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2239  hypothetical protein  39.16 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0136177  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1400  hypothetical protein  47.58 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1370  putative low-redox potential cytochrome  47.58 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4030  putative low-redox potential cytochrome  36.05 
 
 
200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  30.5 
 
 
162 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  34.4 
 
 
168 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  33.33 
 
 
168 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  30.83 
 
 
148 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  28.44 
 
 
173 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  27.5 
 
 
160 aa  48.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  23.98 
 
 
186 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  28.18 
 
 
170 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  28.18 
 
 
161 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1765  diheme cytochrome c  29.41 
 
 
129 aa  45.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.230573  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  23.77 
 
 
192 aa  45.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  25 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  31.87 
 
 
191 aa  45.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  28.57 
 
 
160 aa  44.7  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  25 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  25 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  25 
 
 
187 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>