40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3094 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  100 
 
 
191 aa  394  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  50.27 
 
 
188 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  40.88 
 
 
186 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  38.46 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  37.67 
 
 
160 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  34.41 
 
 
192 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  37.59 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  34.62 
 
 
163 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  36.84 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  37.12 
 
 
162 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  35.71 
 
 
363 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  36.84 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  35.71 
 
 
363 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  36.84 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  33.09 
 
 
168 aa  95.5  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  36.09 
 
 
187 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  36.09 
 
 
187 aa  94.7  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  36.64 
 
 
173 aa  94.4  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  32.4 
 
 
387 aa  94.4  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  36.09 
 
 
187 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  35.34 
 
 
187 aa  94  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  36.49 
 
 
160 aa  94  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  36.09 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  36.3 
 
 
153 aa  92.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  34.09 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1765  diheme cytochrome c  37.5 
 
 
129 aa  89.4  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.230573  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  34.93 
 
 
161 aa  88.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  33.56 
 
 
170 aa  87.8  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  36.05 
 
 
148 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  37.93 
 
 
168 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  32.48 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  27.13 
 
 
365 aa  78.2  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3183  diheme cytochrome c  29.85 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4030  putative low-redox potential cytochrome  26.29 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0587  hypothetical protein  30 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147983  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1370  putative low-redox potential cytochrome  36.84 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1400  hypothetical protein  36.84 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2239  hypothetical protein  24.39 
 
 
171 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0136177  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4636  hypothetical protein  31.87 
 
 
181 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2123  hypothetical protein  24.58 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>