37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3183 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3183  diheme cytochrome c  100 
 
 		 162 aa  323  6e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  44.03 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  49.24 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  47.4 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  35.97 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  37.7 
 
 		 387 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  42.74 
 
 		 177 aa  91.3  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  36.2 
 
 		 187 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  36.2 
 
 		 187 aa  87.8  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  36.2 
 
 		 187 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  40.32 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  34.81 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  34.81 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  27.82 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  40.94 
 
 		 363 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  40.94 
 
 		 363 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  32.52 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  29.41 
 
 		 365 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  34.78 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  33.54 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  33.54 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  29.85 
 
 		 191 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  32.92 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  31.85 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1765  diheme cytochrome c  35.25 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.230573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  34.11 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  32.68 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  34.65 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  32.82 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  33.86 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  33.07 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  26.87 
 
 		 387 aa  57.4  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4030  putative low-redox potential cytochrome  23.97 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0587  hypothetical protein  36.17 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1370  putative low-redox potential cytochrome  29.33 
 
 		 177 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1400  hypothetical protein  29.33 
 
 		 177 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>