41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6224 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  100 
 
 		 168 aa  343  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  91.89 
 
 		 148 aa  265  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  62.84 
 
 		 168 aa  188  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  56.76 
 
 		 162 aa  177  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  53.95 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  47.33 
 
 		 173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1765  diheme cytochrome c  48.33 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.230573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  41.14 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  40.77 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  35.09 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  37.75 
 
 		 153 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  37.04 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  37.2 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  35.98 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  35.98 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  36.42 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  35.8 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  35.09 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  34.76 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  39.52 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  40.46 
 
 		 387 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  37.93 
 
 		 191 aa  94.4  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  39.35 
 
 		 163 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  38.89 
 
 		 363 aa  90.9  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  38.89 
 
 		 363 aa  90.9  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  39.69 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  38.17 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  29.01 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  28.93 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  29.86 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  32.03 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3183  diheme cytochrome c  33.86 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  28.46 
 
 		 387 aa  65.5  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2239  hypothetical protein  29.2 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0136177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4030  putative low-redox potential cytochrome  29.46 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2123  hypothetical protein  29.66 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0587  hypothetical protein  30.77 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3268  diheme cytochrome c  28.81 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.333963  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1370  putative low-redox potential cytochrome  30.7 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1400  hypothetical protein  30.7 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>