38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0587 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0587  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147983  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3268  diheme cytochrome c  45.51 
 
 
178 aa  180  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.333963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2123  hypothetical protein  45.6 
 
 
180 aa  166  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1400  hypothetical protein  50.77 
 
 
177 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1370  putative low-redox potential cytochrome  50.77 
 
 
177 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2239  hypothetical protein  44.06 
 
 
171 aa  136  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0136177  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4030  putative low-redox potential cytochrome  47.54 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4636  hypothetical protein  45.67 
 
 
181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  32.39 
 
 
162 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  34.48 
 
 
168 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  27.35 
 
 
160 aa  55.1  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  29.71 
 
 
177 aa  55.1  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  28.46 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  30.47 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  30 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  31.47 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  30.47 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  30.47 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  32 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  24.77 
 
 
173 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  29.69 
 
 
187 aa  52  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  29.37 
 
 
183 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  29.37 
 
 
183 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  29.37 
 
 
187 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  29.37 
 
 
187 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  30.77 
 
 
148 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  30.7 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  30.77 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  25.19 
 
 
168 aa  50.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  28.12 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  30.23 
 
 
161 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  30.23 
 
 
170 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  27.03 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1765  diheme cytochrome c  23.89 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.230573  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  24.32 
 
 
387 aa  45.1  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  38 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3183  diheme cytochrome c  36.17 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  25.44 
 
 
387 aa  42  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>