39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2813 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  319  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1765  diheme cytochrome c  47.24 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.230573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  45.53 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  41.45 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  40.88 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  41.67 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  35.53 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  41.91 
 
 		 363 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  41.91 
 
 		 363 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  37.75 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  42.74 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  38.12 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  35.77 
 
 		 387 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  33.77 
 
 		 183 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  42.15 
 
 		 163 aa  94.4  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  33.12 
 
 		 183 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  35.66 
 
 		 187 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  35.66 
 
 		 187 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  36.3 
 
 		 191 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  34.62 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  34.35 
 
 		 188 aa  92  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  33.61 
 
 		 365 aa  90.9  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  34.88 
 
 		 187 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  34.11 
 
 		 187 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  32.82 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  33.33 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  33.33 
 
 		 187 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  39.83 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  39.17 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  80.5  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  30.53 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3183  diheme cytochrome c  33.33 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  31.9 
 
 		 387 aa  54.3  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4030  putative low-redox potential cytochrome  25.23 
 
 		 200 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0587  hypothetical protein  27.03 
 
 		 189 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1370  putative low-redox potential cytochrome  26.79 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1400  hypothetical protein  26.79 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2239  hypothetical protein  26.09 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0136177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2123  hypothetical protein  25.66 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>