41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3009 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  360  7.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  48.39 
 
 		 168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  53.62 
 
 		 160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  48.7 
 
 		 162 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  43.37 
 
 		 168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  45.64 
 
 		 148 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  49.6 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1765  diheme cytochrome c  48.33 
 
 		 129 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.230573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  45.53 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  43.61 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  37.42 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  35 
 
 		 183 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  33.33 
 
 		 187 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  34.57 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  34.57 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  34.57 
 
 		 187 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  34.38 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  40.48 
 
 		 363 aa  99  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  40.48 
 
 		 363 aa  98.6  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  35.07 
 
 		 365 aa  96.7  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  35.77 
 
 		 192 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  33.74 
 
 		 187 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  33.74 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  33.74 
 
 		 187 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  36.64 
 
 		 191 aa  94.4  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  33.09 
 
 		 387 aa  91.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  35.71 
 
 		 188 aa  91.3  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  38.17 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  38.93 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  31.85 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3183  diheme cytochrome c  35 
 
 		 162 aa  84  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  34.81 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  34.65 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4030  putative low-redox potential cytochrome  28.83 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0587  hypothetical protein  24.77 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3268  diheme cytochrome c  28.57 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.333963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2239  hypothetical protein  27.43 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0136177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2123  hypothetical protein  25.89 
 
 		 180 aa  50.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4636  hypothetical protein  28.44 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1370  putative low-redox potential cytochrome  22.5 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1400  hypothetical protein  22.5 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>