41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0137 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  100 
 
 		 177 aa  368  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  42.05 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  47.52 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  40.11 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  38.89 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  38.33 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  38.33 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  44.59 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  37.85 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  36.72 
 
 		 187 aa  127  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  39.31 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  38.86 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  37.64 
 
 		 187 aa  124  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  37.08 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  36.84 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  38.64 
 
 		 387 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  41.57 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  37.16 
 
 		 191 aa  117  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  44.78 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  43.97 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  37.5 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  40.58 
 
 		 363 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  43.26 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  38.12 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  32.95 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  40.58 
 
 		 363 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  30.08 
 
 		 365 aa  105  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1765  diheme cytochrome c  37.96 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.230573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  37.5 
 
 		 148 aa  104  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3183  diheme cytochrome c  39.86 
 
 		 162 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  36.84 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  26.32 
 
 		 168 aa  85.1  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  27.91 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0587  hypothetical protein  30.5 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4030  putative low-redox potential cytochrome  25.42 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3268  diheme cytochrome c  27.97 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.333963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2239  hypothetical protein  27.42 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0136177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1370  putative low-redox potential cytochrome  24.79 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1400  hypothetical protein  24.79 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4636  hypothetical protein  24.37 
 
 		 181 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2123  hypothetical protein  24.59 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>