39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4030 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4030  putative low-redox potential cytochrome  100 
 
 		 200 aa  417  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1400  hypothetical protein  43.5 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1370  putative low-redox potential cytochrome  43.5 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2123  hypothetical protein  37.3 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0587  hypothetical protein  47.54 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3268  diheme cytochrome c  34.05 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.333963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2239  hypothetical protein  38.3 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0136177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4636  hypothetical protein  39.55 
 
 		 181 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  33.33 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  29.63 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  28.83 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  27.78 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  26.29 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  28.04 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  29.46 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  28.45 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  24.59 
 
 		 387 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  29.46 
 
 		 160 aa  52.4  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  24.67 
 
 		 387 aa  51.2  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  24.63 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  25.19 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  25.19 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  25.19 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  23.88 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  23.88 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  23.88 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  23.88 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  23.88 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  23.58 
 
 		 365 aa  48.5  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  25.76 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  25.23 
 
 		 153 aa  48.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  25.42 
 
 		 177 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  22.31 
 
 		 363 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  24.32 
 
 		 161 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  22.31 
 
 		 363 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  23.42 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3183  diheme cytochrome c  23.97 
 
 		 162 aa  42.4  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  24.8 
 
 		 168 aa  41.6  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>