22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2123 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2123  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  371  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3268  diheme cytochrome c  60.67 
 
 
178 aa  242  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.333963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0587  hypothetical protein  43.41 
 
 
189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147983  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4636  hypothetical protein  53.97 
 
 
181 aa  154  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2239  hypothetical protein  46.58 
 
 
171 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0136177  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4030  putative low-redox potential cytochrome  37.3 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1400  hypothetical protein  39.52 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1370  putative low-redox potential cytochrome  39.52 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  29.66 
 
 
162 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  29.57 
 
 
148 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  30.09 
 
 
168 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  29.66 
 
 
168 aa  51.2  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  25.89 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  26.55 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  27.83 
 
 
170 aa  47.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  22.83 
 
 
387 aa  47.8  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  27.83 
 
 
161 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  22.22 
 
 
160 aa  45.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  44.3  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  21.95 
 
 
188 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  24.58 
 
 
191 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  25.66 
 
 
153 aa  40.8  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>