126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1406 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1406  cytochrome B561  100 
 
 		 245 aa  482  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  33.73 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  31.94 
 
 		 387 aa  97.1  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  30.54 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  32.51 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  36.22 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  33.33 
 
 		 192 aa  88.6  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  32.56 
 
 		 195 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  34 
 
 		 349 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  33.72 
 
 		 182 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  33.83 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  33.83 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  35.96 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  32.66 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5695  putative cytochrome b561 family protein  35.43 
 
 		 193 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  31.72 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  36.99 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  36.99 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  31.4 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  26.04 
 
 		 387 aa  79  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  27.1 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  34.48 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  28.49 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  30.34 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  32.37 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  27.08 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  26.56 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  31.68 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1304  putative cytochrome b561 family protein  29.26 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  26.32 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  30.64 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  29.79 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  29.89 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  29.89 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  29.89 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  34.54 
 
 		 203 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  26.56 
 
 		 198 aa  72  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  29.89 
 
 		 195 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  24.66 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  28.8 
 
 		 195 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  29.17 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  28.64 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  31.15 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  30.59 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  30.81 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1491  cytochrome B561  33.53 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.268011 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  26.2 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1811  cytochrome B561  35.26 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2807  putative cytochrome b  32.94 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4949  cytochrome B561  30.65 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  34.48 
 
 		 175 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1227  cytochrome B561  27.27 
 
 		 175 aa  67  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  28.24 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  27.98 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  27.23 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  25.23 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  29.83 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  26.26 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  26.42 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  29.89 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  31.58 
 
 		 178 aa  62  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0316  cytochrome B561  29.32 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1534  cytochrome B561  30.86 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  29.35 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  25.23 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  27.89 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  34.62 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  34.62 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  34.62 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  26.7 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  34.65 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3509  cytochrome B561  28 
 
 		 181 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  28.91 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  26.98 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  28.42 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  28.42 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1896  cytochrome b561 family protein  26.86 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.832729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2214  cytochrome B561  29.41 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312058  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2726  cytochrome b, putative  27.08 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0655  hypothetical protein  30.87 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2729  cytochrome B561  29.41 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2317  cytochrome B561  26.39 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0816161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2387  cytochrome B561  26.39 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.549561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  26.78 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  25 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  25 
 
 		 230 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  25 
 
 		 230 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  25.67 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  26.77 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  27.27 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2388  cytochrome b561  25.74 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  24.39 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  22.12 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  26.23 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  26.01 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3421  b-type cytochrome, putative  29.92 
 
 		 230 aa  48.9  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0139  cytochrome b, putative  29.56 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  29.69 
 
 		 227 aa  48.9  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1933  cytochrome B561  33.83 
 
 		 185 aa  48.9  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0590  cytochrome B561  30.1 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>