More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0709 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0709  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 175 aa  343  7e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000966721  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  44.12 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  46.11 
 
 		 173 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  48.28 
 
 		 202 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1253  translation initiation factor IF-3  56.94 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00905146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1203  translation initiation factor IF-3  54.3 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000877866  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 174 aa  157  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  46.99 
 
 		 170 aa  153  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  47.67 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  45.91 
 
 		 194 aa  153  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  47.5 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  45.96 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  44.16 
 
 		 173 aa  148  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  45.33 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  45.4 
 
 		 249 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  52.82 
 
 		 145 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1509  translation initiation factor IF-3  44.68 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00441613  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  42.51 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  43.75 
 
 		 169 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  43.02 
 
 		 195 aa  141  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  43.02 
 
 		 195 aa  141  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  43.02 
 
 		 195 aa  141  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  43.02 
 
 		 195 aa  141  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  43.02 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  43.98 
 
 		 172 aa  142  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  42.11 
 
 		 198 aa  141  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  43.12 
 
 		 170 aa  140  9e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  45.62 
 
 		 173 aa  140  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  44 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  41.32 
 
 		 252 aa  139  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  42.17 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  42.17 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  45.64 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  41.25 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0923  translation initiation factor IF-3  56.74 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000477215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  42.44 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  43.12 
 
 		 177 aa  139  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  45 
 
 		 179 aa  138  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  40.72 
 
 		 225 aa  138  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  42.5 
 
 		 171 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  45 
 
 		 164 aa  137  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  40.72 
 
 		 238 aa  137  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  44.38 
 
 		 164 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  39.13 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  43.75 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  42.86 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  42.86 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  43.75 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  41.25 
 
 		 171 aa  135  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  41.92 
 
 		 176 aa  134  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  43.03 
 
 		 182 aa  134  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  40.62 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  40.62 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  41.61 
 
 		 351 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  39.88 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  41.88 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  45 
 
 		 233 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  47.62 
 
 		 175 aa  130  7.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000317297  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  42.5 
 
 		 173 aa  130  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  42.5 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  50.33 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  40.37 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0679  translation initiation factor IF-3  48.75 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  40.36 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  41.25 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0708  translation initiation factor IF-3  44.91 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00002338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  41.25 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  44.38 
 
 		 230 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  44.38 
 
 		 232 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  39.75 
 
 		 173 aa  127  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  38.12 
 
 		 277 aa  127  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  42.17 
 
 		 176 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  43.33 
 
 		 151 aa  127  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  38.75 
 
 		 219 aa  127  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  40 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  41.61 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  38.89 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  40.37 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  44.38 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  45.62 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  40 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4551  translation initiation factor IF-3  37.87 
 
 		 221 aa  125  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  40.37 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  39.75 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  42.67 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21910  translation initiation factor 3  39.38 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  39.05 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  40 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  40.62 
 
 		 239 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  39.38 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  38.92 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>