More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1203 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1203  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 150 aa  303  7e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000877866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1253  translation initiation factor IF-3  93.75 
 
 		 144 aa  259  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00905146  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  62.25 
 
 		 176 aa  199  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0923  translation initiation factor IF-3  68.09 
 
 		 141 aa  189  9e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000477215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  53.69 
 
 		 174 aa  168  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  55.7 
 
 		 173 aa  168  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  49.32 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  51.01 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  50.34 
 
 		 202 aa  157  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  48.67 
 
 		 165 aa  156  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  48 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  50.67 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 194 aa  154  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0709  translation initiation factor IF-3  52.98 
 
 		 175 aa  154  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000966721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  48.03 
 
 		 219 aa  154  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  52.05 
 
 		 197 aa  153  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  49.66 
 
 		 207 aa  153  9e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 		 190 aa  151  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 176 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  49.66 
 
 		 172 aa  150  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  48.68 
 
 		 249 aa  150  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  51.33 
 
 		 192 aa  150  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 164 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  45.03 
 
 		 202 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  46.94 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  48.67 
 
 		 173 aa  148  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 181 aa  148  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  48.97 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  49.33 
 
 		 173 aa  148  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  44.74 
 
 		 178 aa  148  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  47.37 
 
 		 178 aa  147  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  47.37 
 
 		 178 aa  147  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  51.33 
 
 		 173 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  50.35 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  49.33 
 
 		 169 aa  146  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  44.74 
 
 		 187 aa  146  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  45.64 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  47.33 
 
 		 176 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  48.3 
 
 		 277 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  50.68 
 
 		 198 aa  145  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  50.69 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  52.14 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  46.98 
 
 		 238 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  47.95 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  52.67 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  47.33 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  51.02 
 
 		 351 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  50.67 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  47.33 
 
 		 173 aa  144  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0679  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 168 aa  144  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  47.65 
 
 		 169 aa  144  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  53.1 
 
 		 233 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  48.32 
 
 		 168 aa  144  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  46.98 
 
 		 225 aa  144  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  45.03 
 
 		 190 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  48.67 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  49.66 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1509  translation initiation factor IF-3  49.62 
 
 		 204 aa  144  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00441613  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  53.1 
 
 		 232 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  53.1 
 
 		 230 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  44.67 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  47.95 
 
 		 243 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  50.34 
 
 		 204 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  49.32 
 
 		 177 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  51.02 
 
 		 178 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1733  translation initiation factor IF-3  48.61 
 
 		 212 aa  143  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.128322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  46 
 
 		 177 aa  143  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  48 
 
 		 173 aa  142  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  45.89 
 
 		 401 aa  143  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  47.95 
 
 		 179 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  48.98 
 
 		 176 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 178 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  51.02 
 
 		 155 aa  141  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  48.98 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  48.65 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  45.33 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  48.63 
 
 		 225 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  42.95 
 
 		 170 aa  141  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  46 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  47.62 
 
 		 192 aa  141  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  47.95 
 
 		 170 aa  141  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  49.66 
 
 		 233 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  47.59 
 
 		 227 aa  141  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  48.63 
 
 		 212 aa  141  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  47.68 
 
 		 182 aa  140  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 173 aa  140  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  48.34 
 
 		 219 aa  140  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  42.67 
 
 		 179 aa  140  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1880  translation initiation factor IF-3  51.72 
 
 		 229 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  46.26 
 
 		 198 aa  140  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0232  translation initiation factor 3  48.95 
 
 		 211 aa  139  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.627991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  44.59 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  48.61 
 
 		 195 aa  139  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  44.67 
 
 		 177 aa  139  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  44.59 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  43.84 
 
 		 176 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>