More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21910 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_21910  translation initiation factor 3  100 
 
 
208 aa  417  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  69.47 
 
 
329 aa  266  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  60.93 
 
 
233 aa  263  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  69.89 
 
 
401 aa  261  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  68.09 
 
 
415 aa  259  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  66.83 
 
 
351 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  68.95 
 
 
199 aa  258  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  73.65 
 
 
277 aa  256  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  73.81 
 
 
396 aa  253  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  69.49 
 
 
250 aa  252  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  73.81 
 
 
356 aa  251  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  64.89 
 
 
212 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  69.41 
 
 
225 aa  245  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  63.92 
 
 
192 aa  241  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  69.46 
 
 
182 aa  239  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  69.28 
 
 
222 aa  238  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  63.89 
 
 
243 aa  235  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  68.86 
 
 
204 aa  234  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  70.06 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  67.66 
 
 
196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  71.7 
 
 
177 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  63.84 
 
 
201 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  67.07 
 
 
227 aa  228  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  60.75 
 
 
238 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  60.75 
 
 
238 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  57.71 
 
 
243 aa  228  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  60.75 
 
 
238 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  64.07 
 
 
205 aa  228  7e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  69.33 
 
 
195 aa  227  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  69.75 
 
 
168 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  57.78 
 
 
182 aa  214  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  61.82 
 
 
239 aa  211  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  57.87 
 
 
253 aa  208  5e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  61.73 
 
 
204 aa  207  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1728  initiation factor 3  66.67 
 
 
149 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00351932  hitchhiker  0.00163995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3542  initiation factor 3  65.25 
 
 
175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.407448  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0232  translation initiation factor 3  57.05 
 
 
211 aa  186  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.627991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  50.5 
 
 
357 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 
202 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  53.7 
 
 
175 aa  175  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  48.07 
 
 
207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 
178 aa  170  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  51.19 
 
 
219 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  46.33 
 
 
197 aa  170  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 
173 aa  168  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  49.38 
 
 
179 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  48.17 
 
 
198 aa  166  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 
174 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  51.22 
 
 
198 aa  165  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 
186 aa  164  8e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 
178 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  49.1 
 
 
173 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  48.19 
 
 
173 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  44.72 
 
 
238 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  48.19 
 
 
178 aa  161  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  48.19 
 
 
178 aa  161  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 
165 aa  161  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  52.67 
 
 
154 aa  161  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 
192 aa  161  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 
183 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 
183 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  50.31 
 
 
182 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 
183 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 
177 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 
194 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  48.17 
 
 
184 aa  159  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 
194 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
169 aa  158  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 
164 aa  158  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 
174 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  48.21 
 
 
175 aa  156  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 
194 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 
173 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 
225 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  50.33 
 
 
155 aa  155  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  46.99 
 
 
169 aa  155  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 
166 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  47.27 
 
 
190 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 
166 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 
166 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 
195 aa  154  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 
186 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 
166 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 
195 aa  154  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 
195 aa  154  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 
195 aa  154  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 
195 aa  154  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 
177 aa  154  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  50.65 
 
 
154 aa  154  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  48.08 
 
 
181 aa  154  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 
202 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  44.81 
 
 
184 aa  153  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 
166 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 
182 aa  153  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 
177 aa  152  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0679  translation initiation factor IF-3  51.79 
 
 
168 aa  153  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  46.39 
 
 
187 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  49.07 
 
 
177 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>