More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1253 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1253  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
144 aa  291  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00905146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1203  translation initiation factor IF-3  93.75 
 
 
150 aa  258  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000877866  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  62.5 
 
 
176 aa  192  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0923  translation initiation factor IF-3  68.79 
 
 
141 aa  191  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000477215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  51.39 
 
 
154 aa  163  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  54.93 
 
 
174 aa  161  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  52.82 
 
 
173 aa  157  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  54.17 
 
 
173 aa  157  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0709  translation initiation factor IF-3  56.25 
 
 
175 aa  155  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000966721  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  54.23 
 
 
197 aa  153  8e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  52.45 
 
 
172 aa  152  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  52.48 
 
 
145 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  53.52 
 
 
194 aa  151  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  51.05 
 
 
171 aa  151  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  51.03 
 
 
207 aa  150  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  52.78 
 
 
146 aa  148  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  48.25 
 
 
154 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  53.57 
 
 
143 aa  148  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  48.25 
 
 
185 aa  147  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  51.05 
 
 
154 aa  147  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  49.65 
 
 
181 aa  147  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  48.95 
 
 
165 aa  147  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  48.95 
 
 
164 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  50.71 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  47.59 
 
 
187 aa  144  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  46.9 
 
 
178 aa  144  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  47.22 
 
 
164 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  48.94 
 
 
202 aa  143  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  50.7 
 
 
169 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  52.11 
 
 
198 aa  143  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  47.18 
 
 
186 aa  142  2e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  49.3 
 
 
182 aa  142  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  49.31 
 
 
178 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  49.31 
 
 
178 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  45.83 
 
 
202 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  46.21 
 
 
219 aa  142  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  48.28 
 
 
249 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
351 aa  142  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
176 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  46.53 
 
 
190 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  51.05 
 
 
154 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  48.95 
 
 
177 aa  141  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1509  translation initiation factor IF-3  50.39 
 
 
204 aa  141  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00441613  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  47.55 
 
 
175 aa  140  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  50.7 
 
 
177 aa  140  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  47.22 
 
 
166 aa  139  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  47.22 
 
 
166 aa  139  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  48.59 
 
 
173 aa  139  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  46.53 
 
 
166 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  46.53 
 
 
166 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  50.69 
 
 
190 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  52.11 
 
 
233 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0232  translation initiation factor 3  48.25 
 
 
211 aa  139  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.627991  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  47.89 
 
 
277 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  46.53 
 
 
195 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  46.53 
 
 
195 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  46.53 
 
 
195 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  46.53 
 
 
195 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  52.11 
 
 
230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  49.3 
 
 
173 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  46.53 
 
 
186 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  50.35 
 
 
151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  52.11 
 
 
232 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
192 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  46.53 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  50.7 
 
 
175 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  48.59 
 
 
243 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  49.65 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  49.3 
 
 
168 aa  138  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  48.59 
 
 
227 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  47.22 
 
 
164 aa  138  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  47.89 
 
 
212 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  47.89 
 
 
170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  48.97 
 
 
171 aa  137  3.9999999999999997e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1733  translation initiation factor IF-3  47.86 
 
 
212 aa  137  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.128322  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0679  translation initiation factor IF-3  55.94 
 
 
168 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 
179 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  48.59 
 
 
225 aa  137  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  48.59 
 
 
233 aa  137  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  49.65 
 
 
163 aa  137  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  48.59 
 
 
179 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  47.18 
 
 
238 aa  135  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  49.3 
 
 
173 aa  135  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  45.52 
 
 
156 aa  136  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  51.75 
 
 
173 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  48.95 
 
 
204 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  46.85 
 
 
177 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  47.18 
 
 
173 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  47.18 
 
 
176 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  47.89 
 
 
205 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  48.61 
 
 
144 aa  135  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  44.37 
 
 
170 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  47.89 
 
 
225 aa  135  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  49.65 
 
 
178 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  48.95 
 
 
173 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3043  initiation factor 3  48.53 
 
 
139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000731556  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  47.18 
 
 
201 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  47.92 
 
 
159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  50.35 
 
 
155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  47.89 
 
 
196 aa  134  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>