204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1759 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1759  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000334596  normal  0.310649 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0320  30S ribosomal protein S20  89.01 
 
 		 91 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0456  30S ribosomal protein S20  83.33 
 
 		 93 aa  151  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0424  30S ribosomal protein S20  81.32 
 
 		 91 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0389  30S ribosomal protein S20  74.73 
 
 		 91 aa  140  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0388  30S ribosomal protein S20  76.92 
 
 		 91 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000012628  normal  0.0229043 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0421  30S ribosomal protein S20  75.82 
 
 		 91 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.297781  normal  0.0196002 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  47.73 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  40.79 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  42.11 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  40 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  41.33 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  39.02 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  38.46 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  41.89 
 
 		 87 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6841  ribosomal protein S20  35.23 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1384  ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  37.8 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0856  ribosomal protein S20  34.09 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.819382  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1265  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.15154e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  37.35 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  40.79 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  40.79 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  40.79 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  47.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  33.75 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  33.75 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  33.75 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  33.75 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  33.75 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  40.79 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  35.71 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  36.47 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  39.02 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_002950  PG1723  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  39.02 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  36.59 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  34.09 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  37.08 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0238  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00017388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  36.59 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>