102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1448 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 
442 aa  917    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  41.73 
 
 
432 aa  301  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  35.19 
 
 
465 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  36.2 
 
 
468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  35.61 
 
 
430 aa  252  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  36.52 
 
 
479 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  35.33 
 
 
439 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  36.01 
 
 
422 aa  204  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  32.57 
 
 
449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  33.99 
 
 
448 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  32.49 
 
 
475 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  32.19 
 
 
478 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  31.98 
 
 
484 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  31.55 
 
 
475 aa  180  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  32.27 
 
 
472 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  30.41 
 
 
466 aa  173  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  31.85 
 
 
484 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  31.35 
 
 
486 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  32.51 
 
 
485 aa  170  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  31.13 
 
 
482 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  34.23 
 
 
489 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  30.53 
 
 
473 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  31.36 
 
 
499 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  30.49 
 
 
487 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  31.85 
 
 
487 aa  167  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  30.19 
 
 
478 aa  162  9e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  30.42 
 
 
481 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  30.3 
 
 
486 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  30.31 
 
 
503 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  29.85 
 
 
473 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  30.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  28.33 
 
 
485 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  30.61 
 
 
505 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  28.15 
 
 
481 aa  153  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  28.7 
 
 
503 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  30.59 
 
 
500 aa  149  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  28.14 
 
 
488 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  31.98 
 
 
482 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  27.79 
 
 
493 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  28.83 
 
 
491 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  31.47 
 
 
483 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2868  hypothetical protein  35.04 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  31.68 
 
 
410 aa  60.1  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1794  hypothetical protein  33.63 
 
 
407 aa  60.1  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  37.23 
 
 
387 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  37.78 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3893  twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 
385 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4475  hypothetical protein  31.76 
 
 
385 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2539  protein of unknown function DUF1501  33.33 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3912  hypothetical protein  35.29 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2340  hypothetical protein  34.62 
 
 
405 aa  55.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40083  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4376  hypothetical protein  35.29 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1385  hypothetical protein  35.29 
 
 
385 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18972  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5828  hypothetical protein  31.08 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00482968  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2183  protein of unknown function DUF1501  33 
 
 
394 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0901909  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2473  protein of unknown function DUF1501  32 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  32.04 
 
 
407 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2551  protein of unknown function DUF1501  31.71 
 
 
399 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3484  hypothetical protein  28.41 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2238  hypothetical protein  29.92 
 
 
399 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4086  hypothetical protein  30.77 
 
 
388 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0377  protein of unknown function DUF1501  27.72 
 
 
422 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3059  hypothetical protein  29.27 
 
 
429 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  35.51 
 
 
408 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1103  protein of unknown function DUF1501  28.95 
 
 
454 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  24.05 
 
 
411 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02839  hypothetical protein  29.73 
 
 
379 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  27.45 
 
 
404 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2281  hypothetical protein  32.41 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118635  hitchhiker  0.0000220293 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4004  hypothetical protein  28.42 
 
 
403 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  33.33 
 
 
403 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  26.57 
 
 
394 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  32.52 
 
 
401 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2353  hypothetical protein  34.07 
 
 
389 aa  47  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3443  protein of unknown function DUF1501  36.67 
 
 
386 aa  47  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  30.19 
 
 
415 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  31.9 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6144  twin-arginine translocation pathway signal  29.66 
 
 
406 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1935  hypothetical protein  29.66 
 
 
406 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2158  hypothetical protein  24.81 
 
 
439 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1959  hypothetical protein  29.66 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.309737  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1850  hypothetical protein  28.81 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00703093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  34.48 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1625  hypothetical protein  38.71 
 
 
382 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177694  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2722  hypothetical protein  29.87 
 
 
412 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1336  hypothetical protein  29.75 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000214784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  34.48 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1483  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.93 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0185486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5246  hypothetical protein  31.31 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1923  hypothetical protein  30.3 
 
 
403 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1976  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.93 
 
 
421 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.611081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3329  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.93 
 
 
421 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0404389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1249  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.93 
 
 
421 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2116  protein of unknown function DUF1501  32.47 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199943  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4878  hypothetical protein  34.78 
 
 
445 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0245766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6011  hypothetical protein  33.58 
 
 
404 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5025  protein of unknown function DUF1501  40.66 
 
 
382 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137288  normal  0.0850645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5538  hypothetical protein  29.7 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889473  normal  0.0405308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  31.31 
 
 
513 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2503  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.93 
 
 
418 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>