88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0523 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 
439 aa  898    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  34.76 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  40.45 
 
 
422 aa  257  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  36.43 
 
 
449 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  35.48 
 
 
442 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  31.7 
 
 
432 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  32.95 
 
 
465 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  30.9 
 
 
448 aa  173  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  30.77 
 
 
466 aa  169  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  31.05 
 
 
479 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  27.73 
 
 
475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  28.33 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  30.81 
 
 
473 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  28.2 
 
 
485 aa  146  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  28.12 
 
 
503 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  27.87 
 
 
505 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  27.38 
 
 
500 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  29.39 
 
 
468 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  29.35 
 
 
488 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  27.15 
 
 
489 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  28.79 
 
 
481 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  26.65 
 
 
472 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  25.76 
 
 
486 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  25.79 
 
 
492 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  28.32 
 
 
487 aa  136  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  26.05 
 
 
499 aa  136  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  26.86 
 
 
473 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  25.96 
 
 
484 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  27.31 
 
 
482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  27.99 
 
 
475 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  26.24 
 
 
481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  26.74 
 
 
485 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  25.17 
 
 
484 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  26.3 
 
 
486 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  27.87 
 
 
483 aa  123  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  25.27 
 
 
503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  27.44 
 
 
487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  26.33 
 
 
493 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  28.18 
 
 
478 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  24.95 
 
 
491 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  28.03 
 
 
482 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  38.4 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  35.71 
 
 
394 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  34.75 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  40.43 
 
 
387 aa  57.4  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2868  hypothetical protein  32 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  36 
 
 
411 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  36.26 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  42.7 
 
 
408 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  42.22 
 
 
403 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1850  hypothetical protein  34.29 
 
 
403 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00703093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  22.37 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6144  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1935  hypothetical protein  33.33 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884799  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2281  hypothetical protein  36.19 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118635  hitchhiker  0.0000220293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  33.33 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1959  hypothetical protein  33.33 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.309737  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  32.98 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  31.48 
 
 
404 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  35.19 
 
 
407 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1882  protein of unknown function DUF1501  34.07 
 
 
414 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5246  hypothetical protein  33.33 
 
 
406 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1923  hypothetical protein  32.38 
 
 
403 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1336  hypothetical protein  33.33 
 
 
403 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000214784 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2503  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.97 
 
 
418 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1249  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.97 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66735  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2539  protein of unknown function DUF1501  36.78 
 
 
409 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2348  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.97 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3329  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.97 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0404389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1976  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.97 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.611081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1483  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.97 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0185486  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3876  protein of unknown function DUF1501  34.41 
 
 
425 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2097  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.97 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5180  hypothetical protein  35.16 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134419  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0704  protein of unknown function DUF1501  33.01 
 
 
422 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3059  hypothetical protein  32.99 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  26.92 
 
 
513 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3315  protein of unknown function DUF1501  36.04 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3484  hypothetical protein  29.58 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06463  hypothetical protein  29.81 
 
 
448 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2390  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.87 
 
 
418 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4004  hypothetical protein  32.2 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  30.19 
 
 
391 aa  44.3  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2158  hypothetical protein  28.17 
 
 
439 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1794  hypothetical protein  28.35 
 
 
407 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0518  hypothetical protein  32.47 
 
 
388 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4837  hypothetical protein  36.56 
 
 
430 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2116  protein of unknown function DUF1501  34.62 
 
 
405 aa  43.1  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>