56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3817 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 
466 aa  962    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  46.67 
 
 
473 aa  418  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  48.19 
 
 
473 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  43.89 
 
 
482 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  43.82 
 
 
475 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  42.71 
 
 
500 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  41.73 
 
 
503 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  43.8 
 
 
486 aa  372  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  45.79 
 
 
481 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  43.01 
 
 
486 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  44.63 
 
 
488 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  40.82 
 
 
489 aa  365  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  42.05 
 
 
472 aa  363  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  42.41 
 
 
484 aa  362  7.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  41.34 
 
 
484 aa  362  9e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  42.18 
 
 
487 aa  358  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  41.36 
 
 
487 aa  354  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  44.01 
 
 
478 aa  354  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  42.6 
 
 
505 aa  352  5.9999999999999994e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  42.05 
 
 
493 aa  348  9e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  39.68 
 
 
492 aa  348  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  41.89 
 
 
491 aa  348  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  42 
 
 
485 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  40.17 
 
 
482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  42.11 
 
 
483 aa  337  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  40.82 
 
 
499 aa  329  7e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  39.59 
 
 
503 aa  329  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  39.31 
 
 
481 aa  323  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  30.7 
 
 
430 aa  173  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  30.41 
 
 
442 aa  173  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  29.41 
 
 
449 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  29.23 
 
 
465 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  30.48 
 
 
485 aa  157  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  29.08 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  30.73 
 
 
448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  29.3 
 
 
422 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  29.16 
 
 
475 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  30.37 
 
 
439 aa  133  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  30.9 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  28.57 
 
 
478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  27.55 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  24.53 
 
 
403 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  29.1 
 
 
408 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  24.71 
 
 
411 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  27.34 
 
 
410 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  40.26 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4475  hypothetical protein  34.68 
 
 
385 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3893  twin-arginine translocation pathway signal  34.68 
 
 
385 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231247  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4376  hypothetical protein  33.87 
 
 
387 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3912  hypothetical protein  33.87 
 
 
387 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1385  hypothetical protein  33.59 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18972  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2181  hypothetical protein  30.1 
 
 
393 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06463  hypothetical protein  29.91 
 
 
448 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  28.76 
 
 
391 aa  43.5  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2868  hypothetical protein  30 
 
 
413 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5828  hypothetical protein  33.87 
 
 
385 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00482968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>