101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1827 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 
422 aa  863    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  40.92 
 
 
430 aa  310  4e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  40.99 
 
 
439 aa  239  6.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  35.17 
 
 
449 aa  219  5e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  36.01 
 
 
442 aa  216  8e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  33.75 
 
 
432 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  29.8 
 
 
465 aa  170  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  29.38 
 
 
448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  29.96 
 
 
473 aa  160  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  29.54 
 
 
478 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  28.95 
 
 
475 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  28.79 
 
 
475 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  26.81 
 
 
479 aa  152  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  30.59 
 
 
468 aa  150  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  29.3 
 
 
466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  29.96 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  27.44 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  29.5 
 
 
484 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  28.71 
 
 
481 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  29.27 
 
 
487 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  29.31 
 
 
486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  29.38 
 
 
484 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  28.3 
 
 
503 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  27.73 
 
 
500 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  27.99 
 
 
482 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  25.47 
 
 
472 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  28.17 
 
 
487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  28.48 
 
 
478 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  28.57 
 
 
492 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  28.88 
 
 
499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  29.25 
 
 
486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  28.1 
 
 
503 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  28.91 
 
 
489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  29.63 
 
 
485 aa  126  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  27.16 
 
 
481 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  25.12 
 
 
493 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  29.07 
 
 
483 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  27.59 
 
 
505 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  27.13 
 
 
482 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  25.12 
 
 
491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  27.68 
 
 
488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1794  hypothetical protein  42.55 
 
 
407 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2183  protein of unknown function DUF1501  37 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0901909  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  29.05 
 
 
415 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2473  protein of unknown function DUF1501  36 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  32.23 
 
 
401 aa  53.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1882  protein of unknown function DUF1501  36.36 
 
 
414 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2539  protein of unknown function DUF1501  38.46 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  36.73 
 
 
387 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2097  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.65 
 
 
420 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  31.67 
 
 
394 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  43.33 
 
 
408 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2503  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.65 
 
 
418 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3893  twin-arginine translocation pathway signal  36.45 
 
 
385 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4475  hypothetical protein  36.45 
 
 
385 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2348  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.65 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1336  hypothetical protein  33.33 
 
 
403 aa  51.2  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000214784 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  35 
 
 
407 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1103  protein of unknown function DUF1501  30 
 
 
454 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1483  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.65 
 
 
414 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0185486  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3912  hypothetical protein  36.45 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1976  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.65 
 
 
421 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.611081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3329  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.65 
 
 
421 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0404389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1249  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.65 
 
 
421 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66735  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4376  hypothetical protein  36.45 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2390  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.65 
 
 
418 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  24.44 
 
 
404 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1850  hypothetical protein  30.83 
 
 
403 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00703093 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1385  hypothetical protein  36.45 
 
 
385 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18972  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6144  twin-arginine translocation pathway signal  34.09 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1935  hypothetical protein  34.09 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884799  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0518  hypothetical protein  27.33 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6011  hypothetical protein  32.64 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1959  hypothetical protein  34.09 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.309737  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5246  hypothetical protein  34.09 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2340  hypothetical protein  38.46 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40083  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5828  hypothetical protein  35.51 
 
 
385 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00482968  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  29.71 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3315  protein of unknown function DUF1501  36.36 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  29.71 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4086  hypothetical protein  34.07 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02839  hypothetical protein  37.93 
 
 
379 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2868  hypothetical protein  30.49 
 
 
413 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1923  hypothetical protein  29.17 
 
 
403 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2281  hypothetical protein  37.08 
 
 
432 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118635  hitchhiker  0.0000220293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  26.92 
 
 
410 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4004  hypothetical protein  34.07 
 
 
403 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06463  hypothetical protein  30.33 
 
 
448 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  31.72 
 
 
403 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3443  protein of unknown function DUF1501  31.52 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2238  hypothetical protein  32.14 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1187  twin-arginine translocation pathway signal  33.93 
 
 
448 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1005  hypothetical protein  36.76 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354968  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  33.7 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4878  hypothetical protein  35.56 
 
 
445 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0245766  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5025  protein of unknown function DUF1501  30.43 
 
 
382 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137288  normal  0.0850645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2473  protein of unknown function DUF1501  31.91 
 
 
390 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  decreased coverage  0.00457551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2551  protein of unknown function DUF1501  32.95 
 
 
399 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201136  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  33.33 
 
 
382 aa  43.5  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4837  hypothetical protein  31.46 
 
 
430 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0615049 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>