59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1889 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 
473 aa  977    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  46.67 
 
 
466 aa  418  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  45.03 
 
 
473 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  43.04 
 
 
475 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  42.54 
 
 
500 aa  363  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  44.13 
 
 
481 aa  360  3e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  42.39 
 
 
503 aa  352  8.999999999999999e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  42.53 
 
 
491 aa  350  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  42.76 
 
 
493 aa  348  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  42.83 
 
 
478 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  40.83 
 
 
489 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  40.17 
 
 
487 aa  340  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  41.13 
 
 
486 aa  340  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  41.34 
 
 
472 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  42.76 
 
 
499 aa  338  9e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  39.04 
 
 
482 aa  337  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  39.59 
 
 
503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  40.38 
 
 
486 aa  332  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  41.36 
 
 
487 aa  328  9e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  41.16 
 
 
482 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  38.92 
 
 
488 aa  326  5e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  38.59 
 
 
484 aa  325  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  38.83 
 
 
484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  39.87 
 
 
505 aa  311  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  42.21 
 
 
483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  38.14 
 
 
492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  39.73 
 
 
485 aa  302  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  37.3 
 
 
481 aa  287  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  30.79 
 
 
430 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  30.53 
 
 
442 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  28.68 
 
 
449 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  27.44 
 
 
422 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  28.33 
 
 
448 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  30.17 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  27.23 
 
 
485 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  29.2 
 
 
468 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  27.57 
 
 
465 aa  120  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  26.34 
 
 
479 aa  113  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  26.43 
 
 
478 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  26.06 
 
 
475 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  26.38 
 
 
439 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1103  protein of unknown function DUF1501  34.68 
 
 
454 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  29.29 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  30.51 
 
 
410 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  28.26 
 
 
387 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  23.98 
 
 
411 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  34.69 
 
 
565 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5828  hypothetical protein  27.18 
 
 
385 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00482968  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1385  hypothetical protein  27.18 
 
 
385 aa  47  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18972  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4376  hypothetical protein  37.5 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4475  hypothetical protein  26.7 
 
 
385 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3912  hypothetical protein  37.5 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3893  twin-arginine translocation pathway signal  26.7 
 
 
385 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231247  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3443  protein of unknown function DUF1501  30.17 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2181  hypothetical protein  27.44 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  26.96 
 
 
404 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2238  hypothetical protein  27.14 
 
 
399 aa  44.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4004  hypothetical protein  25.74 
 
 
403 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  33.33 
 
 
407 aa  43.1  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>