70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3720 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 
430 aa  884    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  40.05 
 
 
422 aa  306  5.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  37.02 
 
 
449 aa  269  5.9999999999999995e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  34.93 
 
 
439 aa  256  5e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  35.04 
 
 
442 aa  253  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  34.96 
 
 
465 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  34.09 
 
 
432 aa  213  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  31.38 
 
 
485 aa  190  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  30.6 
 
 
473 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  30.95 
 
 
448 aa  186  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  31.45 
 
 
468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  30.95 
 
 
481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  29.68 
 
 
475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  31.63 
 
 
473 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  29.34 
 
 
466 aa  176  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  29.25 
 
 
484 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  28.51 
 
 
503 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  28.51 
 
 
482 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  30.17 
 
 
479 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  27.38 
 
 
500 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  28.96 
 
 
478 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  30.28 
 
 
488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  28.81 
 
 
503 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  27.19 
 
 
475 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  29.96 
 
 
486 aa  160  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  28.09 
 
 
484 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  28.22 
 
 
487 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  28.67 
 
 
485 aa  157  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  27.73 
 
 
489 aa  156  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  28.75 
 
 
505 aa  153  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  26.54 
 
 
486 aa  152  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  27.04 
 
 
478 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  28.43 
 
 
492 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  28.66 
 
 
472 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  28.44 
 
 
487 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  25.97 
 
 
499 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  28.63 
 
 
491 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  29.35 
 
 
482 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  27.88 
 
 
481 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  29.51 
 
 
483 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  28.01 
 
 
493 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  29.79 
 
 
415 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  30.46 
 
 
394 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  32.2 
 
 
410 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 
408 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  24.13 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  33.94 
 
 
391 aa  49.7  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  36.9 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  27.51 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  30 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0377  protein of unknown function DUF1501  27.6 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  27.81 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  29.66 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06463  hypothetical protein  24.22 
 
 
448 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  31.93 
 
 
513 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1794  hypothetical protein  26.61 
 
 
407 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2868  hypothetical protein  30.53 
 
 
413 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  29.38 
 
 
382 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4116  protein of unknown function DUF1501  31.37 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1205  hypothetical protein  30.08 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4837  hypothetical protein  26.43 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  31.3 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  32.95 
 
 
401 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2448  hypothetical protein  33.7 
 
 
390 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.236933  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2281  hypothetical protein  33.33 
 
 
432 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118635  hitchhiker  0.0000220293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0167  protein of unknown function DUF1501  36.61 
 
 
454 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103428  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5180  hypothetical protein  34.86 
 
 
395 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134419  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2722  hypothetical protein  31.62 
 
 
412 aa  43.5  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4878  hypothetical protein  35.63 
 
 
445 aa  43.5  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0245766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2539  protein of unknown function DUF1501  36.67 
 
 
409 aa  43.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>