94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4116 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4116  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 		 401 aa  806    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5538  hypothetical protein  71.57 
 
 		 395 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889473  normal  0.0405308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5180  hypothetical protein  67.83 
 
 		 395 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134419  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3315  protein of unknown function DUF1501  61.46 
 
 		 403 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2281  hypothetical protein  58.68 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118635  hitchhiker  0.0000220293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6011  hypothetical protein  58.98 
 
 		 404 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02839  hypothetical protein  58.58 
 
 		 379 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4837  hypothetical protein  51.39 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4878  hypothetical protein  47.65 
 
 		 445 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  36.86 
 
 		 408 aa  254  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  38.54 
 
 		 403 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2868  hypothetical protein  34.99 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1794  hypothetical protein  33.24 
 
 		 407 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2473  protein of unknown function DUF1501  30.89 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2539  protein of unknown function DUF1501  32.63 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0377  protein of unknown function DUF1501  29.16 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3443  protein of unknown function DUF1501  30.46 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  30.83 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2340  hypothetical protein  33.33 
 
 		 405 aa  139  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2183  protein of unknown function DUF1501  28.61 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0901909  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3893  twin-arginine translocation pathway signal  32.82 
 
 		 385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4475  hypothetical protein  32.82 
 
 		 385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1385  hypothetical protein  32.56 
 
 		 385 aa  136  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18972  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1681  hypothetical protein  30.49 
 
 		 400 aa  135  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  28.78 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5828  hypothetical protein  33.09 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00482968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4376  hypothetical protein  32.04 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3912  hypothetical protein  31.78 
 
 		 387 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4086  hypothetical protein  29.31 
 
 		 388 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1625  hypothetical protein  33.58 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177694  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5025  protein of unknown function DUF1501  32.74 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137288  normal  0.0850645 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2353  hypothetical protein  32.43 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4004  hypothetical protein  28.88 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2181  hypothetical protein  29.07 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0704  protein of unknown function DUF1501  28.69 
 
 		 422 aa  125  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2158  hypothetical protein  28.25 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  29.46 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  31.01 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3059  hypothetical protein  27.86 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  28.47 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1205  hypothetical protein  26.94 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  26.59 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2722  hypothetical protein  31.22 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3484  hypothetical protein  27.5 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4217  hypothetical protein  31.22 
 
 		 407 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1005  hypothetical protein  28.84 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354968  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1974  hypothetical protein  30.19 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  29.54 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1483  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.65 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0185486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1976  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.65 
 
 		 421 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.611081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3329  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.65 
 
 		 421 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0404389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1249  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.65 
 
 		 421 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66735  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3876  protein of unknown function DUF1501  29.18 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2503  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.65 
 
 		 418 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2348  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.65 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2390  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.65 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5246  hypothetical protein  29.31 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  29.44 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1959  hypothetical protein  28.37 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.309737  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  26.04 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1882  protein of unknown function DUF1501  29.67 
 
 		 414 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1935  hypothetical protein  28.31 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  25 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6144  twin-arginine translocation pathway signal  28.31 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1850  hypothetical protein  28.53 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00703093 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1336  hypothetical protein  28.35 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000214784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0518  hypothetical protein  26.59 
 
 		 388 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1923  hypothetical protein  29.02 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2097  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.08 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2448  hypothetical protein  29.66 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.236933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  26.96 
 
 		 513 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2473  protein of unknown function DUF1501  26.48 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  decreased coverage  0.00457551 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  25.05 
 
 		 565 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  25 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0048  protein of unknown function DUF1501  23.76 
 
 		 509 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000158784  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1187  twin-arginine translocation pathway signal  26.79 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0967  hypothetical protein  24.51 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1789  protein of unknown function DUF1501  26.53 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2238  hypothetical protein  24.38 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  23.64 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  26.34 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2116  protein of unknown function DUF1501  24.73 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199943  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2551  protein of unknown function DUF1501  24.21 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1451  hypothetical protein  23.68 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000085  DUF1501 domain-containing protein  23.93 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4495  hypothetical protein  26.92 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1103  protein of unknown function DUF1501  25.79 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3514  hypothetical protein  25.48 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0916385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06463  hypothetical protein  35.04 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1611  hypothetical protein  36.22 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00173364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2387  hypothetical protein  36.22 
 
 		 514 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4705  hypothetical protein  35.78 
 
 		 481 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0167  protein of unknown function DUF1501  39.51 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  31.37 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>