54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1262 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 
468 aa  960    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  36.2 
 
 
442 aa  270  5e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  34.34 
 
 
465 aa  254  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  36.01 
 
 
479 aa  244  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  35.6 
 
 
432 aa  210  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  33.26 
 
 
449 aa  194  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  32.12 
 
 
430 aa  193  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  29.86 
 
 
482 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  31.63 
 
 
448 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  30.3 
 
 
489 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  28.99 
 
 
488 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  28.54 
 
 
484 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  30.43 
 
 
486 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  28.29 
 
 
484 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  27.27 
 
 
487 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  30.59 
 
 
422 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  28.71 
 
 
492 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  30.22 
 
 
493 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  29.94 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  29.13 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  27.88 
 
 
500 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  29.76 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  28.43 
 
 
503 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  27.8 
 
 
503 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  28.85 
 
 
481 aa  146  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  29.17 
 
 
472 aa  146  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  29.82 
 
 
475 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  29.39 
 
 
499 aa  143  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  31.34 
 
 
505 aa  143  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  28.71 
 
 
475 aa  143  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  28.91 
 
 
491 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  28.63 
 
 
473 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  29.51 
 
 
485 aa  136  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  27.55 
 
 
466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  29.2 
 
 
473 aa  133  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  29.47 
 
 
482 aa  132  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  28.52 
 
 
487 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  27.35 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  28.54 
 
 
439 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  28 
 
 
481 aa  126  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  28.72 
 
 
483 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  32.69 
 
 
387 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  46.67 
 
 
410 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  34.4 
 
 
391 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  29.37 
 
 
401 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  36.46 
 
 
382 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2340  hypothetical protein  37.93 
 
 
405 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40083  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  27.33 
 
 
415 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  35.58 
 
 
394 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  35.58 
 
 
394 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2448  hypothetical protein  26.85 
 
 
390 aa  43.9  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.236933  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  31.01 
 
 
394 aa  43.5  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1794  hypothetical protein  35.29 
 
 
407 aa  43.5  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  27.01 
 
 
408 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>