44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0814 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
472 aa  986    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  67.73 
 
 
482 aa  671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  64.03 
 
 
503 aa  633  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  64.57 
 
 
489 aa  633  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  63.1 
 
 
487 aa  633  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  68.53 
 
 
486 aa  618  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  60.97 
 
 
486 aa  618  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  62.16 
 
 
484 aa  607  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  64.43 
 
 
492 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  61.31 
 
 
484 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  55.46 
 
 
505 aa  533  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  53.04 
 
 
485 aa  513  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  53.78 
 
 
487 aa  496  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  47.19 
 
 
500 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  48.64 
 
 
493 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  49.66 
 
 
491 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  45.91 
 
 
478 aa  413  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  46.58 
 
 
499 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  43.85 
 
 
503 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  42.05 
 
 
466 aa  363  3e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  41.01 
 
 
481 aa  346  5e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  41.34 
 
 
475 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  41.34 
 
 
473 aa  339  5.9999999999999996e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  42.06 
 
 
473 aa  336  5e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  41.26 
 
 
483 aa  332  7.000000000000001e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  38.06 
 
 
482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  37.04 
 
 
481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  36.27 
 
 
488 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  32.27 
 
 
442 aa  180  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  28.83 
 
 
430 aa  144  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  29.5 
 
 
465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  27.12 
 
 
449 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  28.77 
 
 
468 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  28.7 
 
 
448 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  28.17 
 
 
485 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  27.38 
 
 
479 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  25.47 
 
 
422 aa  123  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  27.79 
 
 
432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  26.65 
 
 
439 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  25.41 
 
 
475 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  25.38 
 
 
478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  32.37 
 
 
410 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  26.32 
 
 
404 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  26.32 
 
 
411 aa  43.1  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>