49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3132 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  70.16 
 
 
483 aa  679    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 
482 aa  980    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  49.05 
 
 
481 aa  444  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  45.29 
 
 
488 aa  410  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  44.38 
 
 
473 aa  362  6e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  43.99 
 
 
475 aa  357  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  40.57 
 
 
503 aa  356  5.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  40.85 
 
 
500 aa  356  6.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  42.6 
 
 
493 aa  351  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  42.7 
 
 
491 aa  350  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  39.31 
 
 
489 aa  342  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  40.79 
 
 
499 aa  341  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  40.17 
 
 
466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  40.45 
 
 
486 aa  340  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  38.79 
 
 
487 aa  339  7e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  41.41 
 
 
484 aa  338  9e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  39.47 
 
 
482 aa  336  5.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  40.4 
 
 
487 aa  333  4e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  40.16 
 
 
484 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  40.16 
 
 
486 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  40.12 
 
 
478 aa  329  7e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  41.16 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  37.17 
 
 
503 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  40.39 
 
 
481 aa  322  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  41.29 
 
 
505 aa  321  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  38.62 
 
 
492 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  38.06 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  37.7 
 
 
485 aa  297  3e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  29.35 
 
 
430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  31.98 
 
 
442 aa  137  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  27.64 
 
 
449 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  28.31 
 
 
432 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  29.47 
 
 
468 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  28.44 
 
 
479 aa  115  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  27.19 
 
 
485 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  27.78 
 
 
465 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  27.13 
 
 
422 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  28.48 
 
 
475 aa  97.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  27.63 
 
 
478 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  28.69 
 
 
448 aa  93.6  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  27.8 
 
 
439 aa  87.4  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  35.71 
 
 
403 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  30.25 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  32.11 
 
 
410 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1103  protein of unknown function DUF1501  27.63 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  32.94 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  33.33 
 
 
394 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  33.33 
 
 
394 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  27.78 
 
 
491 aa  43.9  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>