62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1728 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 
449 aa  919    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  37.76 
 
 
430 aa  265  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  36.2 
 
 
439 aa  220  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  35.17 
 
 
422 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  32.4 
 
 
448 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  32.57 
 
 
442 aa  197  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  33.26 
 
 
468 aa  180  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  30.77 
 
 
475 aa  173  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  28.82 
 
 
473 aa  169  7e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  32.08 
 
 
432 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  31.78 
 
 
465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  30.88 
 
 
478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  29.41 
 
 
466 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  28.18 
 
 
481 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  28.68 
 
 
473 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  29.07 
 
 
485 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  28.35 
 
 
500 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  30.02 
 
 
479 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  27.95 
 
 
503 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  28.37 
 
 
489 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  27.63 
 
 
486 aa  149  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  27.06 
 
 
503 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  29.35 
 
 
487 aa  146  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  29.65 
 
 
485 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  28.28 
 
 
475 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  26.72 
 
 
482 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  28.41 
 
 
488 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  28.38 
 
 
484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  28.8 
 
 
478 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  27.12 
 
 
472 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  27.73 
 
 
493 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  26.8 
 
 
484 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  26.91 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  27.38 
 
 
492 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  27.31 
 
 
505 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  28.33 
 
 
486 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  28.7 
 
 
491 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  27.88 
 
 
487 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  28.69 
 
 
483 aa  130  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  27.64 
 
 
482 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  26.71 
 
 
499 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  28.37 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  30.32 
 
 
391 aa  53.9  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  29.38 
 
 
394 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  30.89 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  24.55 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2116  protein of unknown function DUF1501  31.41 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  30.89 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  28.79 
 
 
524 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  30.3 
 
 
410 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  33.08 
 
 
407 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  26.35 
 
 
415 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  25.14 
 
 
401 aa  46.6  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0167  protein of unknown function DUF1501  34.62 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103428  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  28.35 
 
 
513 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2238  hypothetical protein  26.67 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1850  hypothetical protein  28.33 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00703093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1451  hypothetical protein  29.17 
 
 
410 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2473  protein of unknown function DUF1501  27.37 
 
 
390 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  decreased coverage  0.00457551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0967  hypothetical protein  28.23 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51998  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1923  hypothetical protein  28.33 
 
 
403 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1005  hypothetical protein  32.39 
 
 
388 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354968  normal  0.893923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>