61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2089 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 
448 aa  927    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  32.4 
 
 
449 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  33.99 
 
 
442 aa  200  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  31.73 
 
 
430 aa  192  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  32.81 
 
 
465 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  30.49 
 
 
485 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  32.78 
 
 
432 aa  183  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  29.76 
 
 
468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  29.38 
 
 
422 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  27.11 
 
 
478 aa  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  26.46 
 
 
475 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  30.77 
 
 
466 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  28.34 
 
 
503 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  29.57 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  28.33 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  31.65 
 
 
485 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  29.56 
 
 
487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  29.16 
 
 
484 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  29.23 
 
 
472 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  30.56 
 
 
439 aa  143  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  29.55 
 
 
486 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  27.61 
 
 
481 aa  139  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  30.08 
 
 
500 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  27.55 
 
 
473 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  28.01 
 
 
486 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  28.54 
 
 
505 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  28.03 
 
 
482 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  27.62 
 
 
489 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  27.47 
 
 
503 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  28.86 
 
 
487 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  26.92 
 
 
488 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  28.64 
 
 
478 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  27.37 
 
 
475 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  27.49 
 
 
479 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  27.97 
 
 
499 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  25.5 
 
 
492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  27.43 
 
 
481 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  27.05 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  27.53 
 
 
491 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  26.57 
 
 
493 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  28.69 
 
 
482 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06463  hypothetical protein  33.33 
 
 
448 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  40.24 
 
 
387 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  30.97 
 
 
382 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  31.62 
 
 
411 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  27.73 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  30.63 
 
 
410 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  26.05 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  34.44 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2281  hypothetical protein  28.1 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118635  hitchhiker  0.0000220293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0518  hypothetical protein  31.46 
 
 
388 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4878  hypothetical protein  35.79 
 
 
445 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  39.36 
 
 
408 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4004  hypothetical protein  33.73 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4376  hypothetical protein  34.94 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4475  hypothetical protein  34.94 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3912  hypothetical protein  34.94 
 
 
387 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3893  twin-arginine translocation pathway signal  34.94 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2183  protein of unknown function DUF1501  37.65 
 
 
394 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0901909  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5828  hypothetical protein  34.88 
 
 
385 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00482968  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1385  hypothetical protein  34.94 
 
 
385 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18972  normal  0.172871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>