96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4376 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4376  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  759    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4475  hypothetical protein  90.89 
 
 		 385 aa  690    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1385  hypothetical protein  93.23 
 
 		 385 aa  707    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18972  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3893  twin-arginine translocation pathway signal  90.89 
 
 		 385 aa  690    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3912  hypothetical protein  98.19 
 
 		 387 aa  749    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5828  hypothetical protein  90.62 
 
 		 385 aa  689    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00482968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4086  hypothetical protein  76.68 
 
 		 388 aa  584  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5025  protein of unknown function DUF1501  77.89 
 
 		 382 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137288  normal  0.0850645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1625  hypothetical protein  76.58 
 
 		 382 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177694  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3443  protein of unknown function DUF1501  69.95 
 
 		 386 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4217  hypothetical protein  68.52 
 
 		 407 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1794  hypothetical protein  44.81 
 
 		 407 aa  292  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  42.68 
 
 		 407 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2539  protein of unknown function DUF1501  43.8 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2340  hypothetical protein  41.3 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40083  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  40.67 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  38.21 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2473  protein of unknown function DUF1501  38.61 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2183  protein of unknown function DUF1501  38.75 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0901909  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2181  hypothetical protein  36.46 
 
 		 393 aa  192  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2868  hypothetical protein  34.16 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  33.16 
 
 		 408 aa  186  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4004  hypothetical protein  37.97 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2353  hypothetical protein  40.27 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  34.11 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5538  hypothetical protein  33.94 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889473  normal  0.0405308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0377  protein of unknown function DUF1501  28.88 
 
 		 422 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6011  hypothetical protein  32.41 
 
 		 404 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2281  hypothetical protein  33.43 
 
 		 432 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118635  hitchhiker  0.0000220293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3315  protein of unknown function DUF1501  31.66 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4116  protein of unknown function DUF1501  31.58 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3059  hypothetical protein  29.71 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02839  hypothetical protein  30.25 
 
 		 379 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1681  hypothetical protein  34.62 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5180  hypothetical protein  33.89 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134419  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4837  hypothetical protein  28.91 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1205  hypothetical protein  28.57 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  30.17 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2722  hypothetical protein  30.03 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0704  protein of unknown function DUF1501  25.42 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  28.27 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2158  hypothetical protein  27.92 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1850  hypothetical protein  30.91 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00703093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0518  hypothetical protein  25 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1923  hypothetical protein  31.17 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  28.53 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1882  protein of unknown function DUF1501  30.19 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5246  hypothetical protein  30.6 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1959  hypothetical protein  30.28 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.309737  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1935  hypothetical protein  29.97 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884799  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  28.26 
 
 		 394 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6144  twin-arginine translocation pathway signal  29.97 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2503  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.42 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2348  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.42 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1336  hypothetical protein  30.84 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000214784 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2390  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.42 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1483  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.42 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0185486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3329  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.42 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0404389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1249  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.42 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66735  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1976  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.42 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.611081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3484  hypothetical protein  26.65 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0967  hypothetical protein  27.63 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2097  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.77 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1005  hypothetical protein  29.71 
 
 		 388 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354968  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4878  hypothetical protein  37.68 
 
 		 445 aa  92.8  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0245766  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  28.03 
 
 		 394 aa  90.5  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  25.83 
 
 		 411 aa  89.4  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  23.98 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1611  hypothetical protein  29.02 
 
 		 445 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00173364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06463  hypothetical protein  27.51 
 
 		 448 aa  86.3  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2551  protein of unknown function DUF1501  23.55 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201136  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2238  hypothetical protein  23.39 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  26.08 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1974  hypothetical protein  33.06 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2116  protein of unknown function DUF1501  25.22 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199943  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3876  protein of unknown function DUF1501  29.1 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2473  protein of unknown function DUF1501  26.27 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  decreased coverage  0.00457551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  23.68 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0048  protein of unknown function DUF1501  23.36 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000158784  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1451  hypothetical protein  29.27 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000085  DUF1501 domain-containing protein  26.18 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1187  twin-arginine translocation pathway signal  24.3 
 
 		 448 aa  62.8  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2448  hypothetical protein  27.66 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.236933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0167  protein of unknown function DUF1501  28.21 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  23.35 
 
 		 524 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1789  protein of unknown function DUF1501  31.62 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2387  hypothetical protein  38.38 
 
 		 514 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  35.29 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  41.59 
 
 		 432 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  27.5 
 
 		 565 aa  49.7  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1103  protein of unknown function DUF1501  33.33 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  32.2 
 
 		 481 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  37.5 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  33.87 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  38.96 
 
 		 473 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>