98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06463 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06463  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  929    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000085  DUF1501 domain-containing protein  29.41 
 
 
441 aa  202  9e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1187  twin-arginine translocation pathway signal  33.91 
 
 
448 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3514  hypothetical protein  32.24 
 
 
483 aa  180  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0916385  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4705  hypothetical protein  30.13 
 
 
481 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4495  hypothetical protein  31.04 
 
 
482 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2387  hypothetical protein  25.96 
 
 
514 aa  140  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  24.31 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  25.8 
 
 
394 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5246  hypothetical protein  26.65 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1959  hypothetical protein  26 
 
 
406 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.309737  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1935  hypothetical protein  25.75 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884799  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6144  twin-arginine translocation pathway signal  25.75 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  24.35 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  27.65 
 
 
401 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  24.62 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  24.59 
 
 
394 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1336  hypothetical protein  25.76 
 
 
403 aa  93.6  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000214784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1850  hypothetical protein  26.35 
 
 
403 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00703093 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1923  hypothetical protein  25.86 
 
 
403 aa  94  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2503  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.87 
 
 
418 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2348  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.87 
 
 
413 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2390  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.87 
 
 
418 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2097  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.52 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1483  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.8 
 
 
414 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0185486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1249  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.99 
 
 
421 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66735  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1976  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.99 
 
 
421 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.611081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3329  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.99 
 
 
421 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0404389  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3912  hypothetical protein  27.75 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  24.1 
 
 
408 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0518  hypothetical protein  25.65 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4376  hypothetical protein  27.51 
 
 
387 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2868  hypothetical protein  24.78 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  29.9 
 
 
565 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0967  hypothetical protein  26.3 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51998  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  40 
 
 
513 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  25.24 
 
 
524 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4086  hypothetical protein  42.98 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1789  protein of unknown function DUF1501  25.75 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2473  protein of unknown function DUF1501  25.85 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1385  hypothetical protein  42.48 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18972  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0048  protein of unknown function DUF1501  28.16 
 
 
509 aa  73.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000158784  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4475  hypothetical protein  42.02 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3893  twin-arginine translocation pathway signal  42.02 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231247  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  31.74 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3443  protein of unknown function DUF1501  42.86 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0377  protein of unknown function DUF1501  26.91 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1882  protein of unknown function DUF1501  30.77 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  23.01 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5828  hypothetical protein  41.18 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00482968  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2539  protein of unknown function DUF1501  38.95 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  34.56 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1451  hypothetical protein  24.2 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1611  hypothetical protein  38.78 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00173364  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2722  hypothetical protein  26.39 
 
 
412 aa  67  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  20.98 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2281  hypothetical protein  27.33 
 
 
432 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118635  hitchhiker  0.0000220293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3059  hypothetical protein  24.63 
 
 
429 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  36.84 
 
 
403 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1205  hypothetical protein  33.33 
 
 
402 aa  64.3  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  35.4 
 
 
407 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02839  hypothetical protein  34.31 
 
 
379 aa  63.9  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4004  hypothetical protein  32.76 
 
 
403 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1005  hypothetical protein  25.6 
 
 
388 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354968  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2158  hypothetical protein  24.14 
 
 
439 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0704  protein of unknown function DUF1501  33.59 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2116  protein of unknown function DUF1501  24.93 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1794  hypothetical protein  32.35 
 
 
407 aa  60.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4837  hypothetical protein  35.04 
 
 
430 aa  60.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0167  protein of unknown function DUF1501  36.36 
 
 
454 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103428  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2340  hypothetical protein  31.93 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1103  protein of unknown function DUF1501  37.7 
 
 
454 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2183  protein of unknown function DUF1501  27.52 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0901909  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4878  hypothetical protein  31.91 
 
 
445 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0245766  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2473  protein of unknown function DUF1501  42.65 
 
 
390 aa  57.4  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  decreased coverage  0.00457551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4116  protein of unknown function DUF1501  35.04 
 
 
401 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3315  protein of unknown function DUF1501  36.89 
 
 
403 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2448  hypothetical protein  43.28 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.236933  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5538  hypothetical protein  26.46 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889473  normal  0.0405308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1625  hypothetical protein  40 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177694  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2181  hypothetical protein  31.39 
 
 
393 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6011  hypothetical protein  35.29 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3484  hypothetical protein  35.87 
 
 
439 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5025  protein of unknown function DUF1501  39.13 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137288  normal  0.0850645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4217  hypothetical protein  39.13 
 
 
407 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3876  protein of unknown function DUF1501  26.79 
 
 
425 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  32.5 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1974  hypothetical protein  26.02 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5180  hypothetical protein  39.22 
 
 
395 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134419  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  30.77 
 
 
473 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1681  hypothetical protein  26.01 
 
 
400 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  24.22 
 
 
430 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2238  hypothetical protein  31.82 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2353  hypothetical protein  30.26 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  30.89 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  29.91 
 
 
466 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2551  protein of unknown function DUF1501  30.49 
 
 
399 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>