96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2183 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2183  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 
394 aa  798    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0901909  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2473  protein of unknown function DUF1501  92.89 
 
 
394 aa  754    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2181  hypothetical protein  47.64 
 
 
393 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4004  hypothetical protein  46.06 
 
 
403 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2353  hypothetical protein  49 
 
 
389 aa  300  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2340  hypothetical protein  40.1 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40083  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1794  hypothetical protein  38.64 
 
 
407 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3443  protein of unknown function DUF1501  36.65 
 
 
386 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4376  hypothetical protein  39.03 
 
 
387 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2539  protein of unknown function DUF1501  40.05 
 
 
409 aa  215  9e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3912  hypothetical protein  38.75 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4086  hypothetical protein  38.55 
 
 
388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4475  hypothetical protein  38.64 
 
 
385 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3893  twin-arginine translocation pathway signal  38.64 
 
 
385 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231247  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  36.68 
 
 
403 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  36.71 
 
 
407 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1385  hypothetical protein  38.07 
 
 
385 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18972  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5828  hypothetical protein  38.35 
 
 
385 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00482968  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  32.02 
 
 
408 aa  202  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  34.02 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2868  hypothetical protein  34.07 
 
 
413 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5025  protein of unknown function DUF1501  37.57 
 
 
382 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137288  normal  0.0850645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1625  hypothetical protein  38 
 
 
382 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177694  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4217  hypothetical protein  37.61 
 
 
407 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  34.2 
 
 
382 aa  169  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0377  protein of unknown function DUF1501  30.88 
 
 
422 aa  156  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3059  hypothetical protein  30.4 
 
 
429 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02839  hypothetical protein  32.17 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2722  hypothetical protein  31.6 
 
 
412 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4116  protein of unknown function DUF1501  29.63 
 
 
401 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2281  hypothetical protein  31.78 
 
 
432 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118635  hitchhiker  0.0000220293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0704  protein of unknown function DUF1501  30.91 
 
 
422 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  29.43 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1681  hypothetical protein  30.34 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  29.18 
 
 
394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3876  protein of unknown function DUF1501  31.69 
 
 
425 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2158  hypothetical protein  28.16 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3484  hypothetical protein  28.84 
 
 
439 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5538  hypothetical protein  30.03 
 
 
395 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889473  normal  0.0405308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0967  hypothetical protein  31.06 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51998  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  29.95 
 
 
394 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6011  hypothetical protein  28.82 
 
 
404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  27.83 
 
 
513 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  26.03 
 
 
415 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5180  hypothetical protein  30.75 
 
 
395 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134419  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4837  hypothetical protein  28.94 
 
 
430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3315  protein of unknown function DUF1501  27.84 
 
 
403 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  29.72 
 
 
401 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4878  hypothetical protein  28.16 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0518  hypothetical protein  25.06 
 
 
388 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1935  hypothetical protein  28 
 
 
406 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884799  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6144  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 
406 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1205  hypothetical protein  27.3 
 
 
402 aa  102  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1882  protein of unknown function DUF1501  26.84 
 
 
414 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2390  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.88 
 
 
418 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1959  hypothetical protein  28 
 
 
406 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.309737  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2348  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.16 
 
 
413 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1850  hypothetical protein  28.24 
 
 
403 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00703093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5246  hypothetical protein  28 
 
 
406 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2503  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.67 
 
 
418 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1976  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.64 
 
 
421 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.611081  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  25.79 
 
 
404 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1249  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.64 
 
 
421 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3329  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.64 
 
 
421 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0404389  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  27.75 
 
 
391 aa  100  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1923  hypothetical protein  28 
 
 
403 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1483  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.47 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0185486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2097  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.57 
 
 
420 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1789  protein of unknown function DUF1501  28.53 
 
 
445 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1336  hypothetical protein  28.45 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000214784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1974  hypothetical protein  29.57 
 
 
414 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  25.44 
 
 
411 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0048  protein of unknown function DUF1501  24.76 
 
 
509 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000158784  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  27.75 
 
 
524 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  26.33 
 
 
410 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1005  hypothetical protein  28.87 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354968  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2473  protein of unknown function DUF1501  27.51 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  decreased coverage  0.00457551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1451  hypothetical protein  26.36 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2116  protein of unknown function DUF1501  25 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0167  protein of unknown function DUF1501  26.69 
 
 
454 aa  80.1  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103428  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2551  protein of unknown function DUF1501  26.03 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201136  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2238  hypothetical protein  24.61 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06463  hypothetical protein  25.06 
 
 
448 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1611  hypothetical protein  35.21 
 
 
445 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00173364  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1103  protein of unknown function DUF1501  26.25 
 
 
454 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2448  hypothetical protein  33.33 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.236933  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3514  hypothetical protein  26.22 
 
 
483 aa  63.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0916385  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  22.52 
 
 
565 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000085  DUF1501 domain-containing protein  33.63 
 
 
441 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40571  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  33 
 
 
442 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1187  twin-arginine translocation pathway signal  24.31 
 
 
448 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  36 
 
 
422 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4495  hypothetical protein  29.8 
 
 
482 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4705  hypothetical protein  33.03 
 
 
481 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  23.75 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2387  hypothetical protein  30.97 
 
 
514 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>