42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3701 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 
493 aa  1024    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  63.23 
 
 
503 aa  677    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  69.46 
 
 
500 aa  754    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  86.06 
 
 
491 aa  872    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  55.06 
 
 
499 aa  574  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  49.37 
 
 
478 aa  473  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  49.28 
 
 
482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  47.15 
 
 
489 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  48.47 
 
 
486 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  46.59 
 
 
492 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  45.81 
 
 
487 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  45.69 
 
 
503 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  47.22 
 
 
484 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  47.22 
 
 
487 aa  430  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  47.01 
 
 
484 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  46.79 
 
 
472 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  45 
 
 
486 aa  421  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  46.56 
 
 
505 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  45.76 
 
 
485 aa  413  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  43.35 
 
 
483 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  42.53 
 
 
473 aa  363  4e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  40.85 
 
 
488 aa  361  2e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  41.01 
 
 
482 aa  361  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  40.82 
 
 
466 aa  354  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  41.03 
 
 
481 aa  354  2.9999999999999997e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  40.65 
 
 
475 aa  341  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  38.73 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  35.97 
 
 
481 aa  289  8e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  30.08 
 
 
468 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  28.51 
 
 
430 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  27.73 
 
 
449 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  27.09 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  31.62 
 
 
485 aa  127  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  26.93 
 
 
465 aa  126  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  27.54 
 
 
432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  27.34 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  26.83 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  26.96 
 
 
479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  25.59 
 
 
422 aa  110  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  25.53 
 
 
448 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  25.88 
 
 
439 aa  87.8  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  28.67 
 
 
408 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>