42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4085 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  69.6 
 
 
500 aa  749    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 
491 aa  1023    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  85.66 
 
 
493 aa  862    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  63.16 
 
 
503 aa  671    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  54.29 
 
 
499 aa  570  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  50.21 
 
 
478 aa  481  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  50.31 
 
 
482 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  48.56 
 
 
489 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  47 
 
 
492 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  46.65 
 
 
487 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  48.86 
 
 
486 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  49.59 
 
 
487 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  47.12 
 
 
484 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  47.2 
 
 
486 aa  432  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  46.58 
 
 
484 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  44.29 
 
 
503 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  47.2 
 
 
472 aa  425  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  48.3 
 
 
505 aa  419  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  47.51 
 
 
485 aa  416  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  42.53 
 
 
473 aa  364  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  42.32 
 
 
483 aa  358  9e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  41.12 
 
 
466 aa  354  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  40.81 
 
 
482 aa  354  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  40.95 
 
 
481 aa  352  8e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  39.56 
 
 
488 aa  345  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  41.74 
 
 
475 aa  343  5.999999999999999e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  38.72 
 
 
473 aa  329  8e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  35.88 
 
 
481 aa  285  9e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  28.69 
 
 
430 aa  148  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  29.02 
 
 
468 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  28.83 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  28.7 
 
 
449 aa  133  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  27.2 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  29.3 
 
 
485 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  27 
 
 
432 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  25.12 
 
 
422 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  25.24 
 
 
478 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  26.08 
 
 
475 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  27.06 
 
 
448 aa  97.4  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  24.95 
 
 
479 aa  96.3  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  24.62 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 
408 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>