103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4095 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 
432 aa  893    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  40 
 
 
442 aa  315  9e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  34.42 
 
 
465 aa  254  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  34.97 
 
 
468 aa  223  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  34.09 
 
 
430 aa  219  6e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  31.83 
 
 
479 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  31.47 
 
 
439 aa  203  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  33.56 
 
 
448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  33.18 
 
 
422 aa  188  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  32.08 
 
 
449 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  30.38 
 
 
475 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  30.54 
 
 
481 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  29.69 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  29.68 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  28.51 
 
 
478 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  29.32 
 
 
473 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  28.86 
 
 
487 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  30.26 
 
 
487 aa  143  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  30.88 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  31.21 
 
 
499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  28.11 
 
 
485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  28.34 
 
 
500 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  27.33 
 
 
503 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  27.23 
 
 
472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  26.53 
 
 
482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  29.61 
 
 
488 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  28.89 
 
 
473 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  27.53 
 
 
482 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  29.34 
 
 
486 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  27.54 
 
 
493 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  28.18 
 
 
505 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  27.21 
 
 
485 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  26.16 
 
 
489 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  29.14 
 
 
483 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  26.99 
 
 
486 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  27.06 
 
 
484 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  28.04 
 
 
481 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  27 
 
 
491 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  27.66 
 
 
492 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  27.85 
 
 
484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  26.19 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  45.74 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3893  twin-arginine translocation pathway signal  42.73 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4475  hypothetical protein  42.73 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4376  hypothetical protein  42.73 
 
 
387 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3912  hypothetical protein  42.73 
 
 
387 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1385  hypothetical protein  42.73 
 
 
385 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18972  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5828  hypothetical protein  41.82 
 
 
385 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00482968  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1625  hypothetical protein  36.84 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177694  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  42.7 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5025  protein of unknown function DUF1501  36.31 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137288  normal  0.0850645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2539  protein of unknown function DUF1501  38.02 
 
 
409 aa  60.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4086  hypothetical protein  38.3 
 
 
388 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4004  hypothetical protein  35.83 
 
 
403 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  38.61 
 
 
407 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  38.61 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1794  hypothetical protein  36.46 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1187  twin-arginine translocation pathway signal  39 
 
 
448 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2340  hypothetical protein  41.3 
 
 
405 aa  53.9  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  27.78 
 
 
404 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4878  hypothetical protein  39.33 
 
 
445 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06463  hypothetical protein  30.89 
 
 
448 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  35.05 
 
 
403 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3443  protein of unknown function DUF1501  36.96 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2868  hypothetical protein  29.03 
 
 
413 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3059  hypothetical protein  25.1 
 
 
429 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0518  hypothetical protein  26.48 
 
 
388 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2281  hypothetical protein  33.62 
 
 
432 aa  49.7  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118635  hitchhiker  0.0000220293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  31.62 
 
 
410 aa  49.7  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  31.36 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2158  hypothetical protein  33.67 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4217  hypothetical protein  34.31 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4837  hypothetical protein  28.57 
 
 
430 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0704  protein of unknown function DUF1501  33.33 
 
 
422 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5538  hypothetical protein  35.71 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889473  normal  0.0405308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2722  hypothetical protein  29.71 
 
 
412 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  33.33 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1336  hypothetical protein  31.03 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000214784 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1959  hypothetical protein  30.47 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.309737  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02839  hypothetical protein  34.95 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2473  protein of unknown function DUF1501  22.78 
 
 
394 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  34.38 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  31.97 
 
 
391 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  30.51 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  29.71 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1103  protein of unknown function DUF1501  30.63 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5246  hypothetical protein  29.69 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  31.86 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6144  twin-arginine translocation pathway signal  29.06 
 
 
406 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1935  hypothetical protein  29.06 
 
 
406 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884799  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2183  protein of unknown function DUF1501  24.38 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0901909  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2551  protein of unknown function DUF1501  35.71 
 
 
399 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5180  hypothetical protein  35.19 
 
 
395 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134419  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2503  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.13 
 
 
418 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2348  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.13 
 
 
413 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0759  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  24.58 
 
 
331 aa  44.3  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1483  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.13 
 
 
414 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0185486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1976  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.13 
 
 
421 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.611081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3329  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.13 
 
 
421 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0404389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2390  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.13 
 
 
418 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>