48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0574 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  100 
 
 
483 aa  984    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  70.16 
 
 
482 aa  679    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  47.26 
 
 
481 aa  419  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  42.86 
 
 
488 aa  365  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  44.71 
 
 
493 aa  358  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  41.62 
 
 
503 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  44.32 
 
 
491 aa  352  8e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  42.46 
 
 
475 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  40.85 
 
 
489 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  42 
 
 
473 aa  343  2.9999999999999997e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  41.4 
 
 
500 aa  341  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  41.99 
 
 
486 aa  339  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  40.36 
 
 
499 aa  339  5e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  40.61 
 
 
482 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  42.11 
 
 
466 aa  337  3.9999999999999995e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  41.56 
 
 
505 aa  335  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  41.99 
 
 
487 aa  335  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  40.45 
 
 
484 aa  333  4e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  39.02 
 
 
487 aa  332  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  41.26 
 
 
472 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  40.53 
 
 
484 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  39.92 
 
 
486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  39.52 
 
 
492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  37.73 
 
 
503 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  39.34 
 
 
478 aa  313  3.9999999999999997e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  40 
 
 
481 aa  311  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  42.21 
 
 
473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  38.04 
 
 
485 aa  296  4e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  30.06 
 
 
479 aa  137  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  29.66 
 
 
430 aa  136  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  31.47 
 
 
442 aa  133  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  28.69 
 
 
449 aa  130  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  27.4 
 
 
485 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  29.36 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  28.72 
 
 
468 aa  111  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  29.07 
 
 
422 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  36.06 
 
 
465 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  29.76 
 
 
478 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  27.57 
 
 
475 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  29.51 
 
 
448 aa  96.7  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  27.61 
 
 
439 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  32.41 
 
 
411 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1103  protein of unknown function DUF1501  25.46 
 
 
454 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  36.47 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  33.87 
 
 
403 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2116  protein of unknown function DUF1501  40 
 
 
405 aa  47.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199943  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2387  hypothetical protein  31.68 
 
 
514 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4878  hypothetical protein  28.46 
 
 
445 aa  43.5  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0245766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>