43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1977 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5933  protein of unknown function DUF1501  64.3 
 
 
489 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1045  protein of unknown function DUF1501  62.89 
 
 
482 aa  646    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0960  protein of unknown function DUF1501  88.43 
 
 
484 aa  917    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000399872  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2202  protein of unknown function DUF1501  63.73 
 
 
487 aa  652    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1333  protein of unknown function DUF1501  65.27 
 
 
492 aa  647    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1594  protein of unknown function DUF1501  76.95 
 
 
486 aa  803    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200905  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1977  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 
484 aa  1006    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0800398  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0332  protein of unknown function DUF1501  59.88 
 
 
503 aa  628  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0814  twin-arginine translocation pathway signal  61.31 
 
 
472 aa  600  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4138  protein of unknown function DUF1501  58.86 
 
 
486 aa  590  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2948  protein of unknown function DUF1501  53.7 
 
 
505 aa  544  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  54.83 
 
 
485 aa  538  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1525  protein of unknown function DUF1501  52.7 
 
 
487 aa  514  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2714  protein of unknown function DUF1501  47.44 
 
 
503 aa  438  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5451  protein of unknown function DUF1501  45.51 
 
 
500 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3701  protein of unknown function DUF1501  48.87 
 
 
493 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1795  protein of unknown function DUF1501  47.7 
 
 
478 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3228  protein of unknown function DUF1501  46.06 
 
 
499 aa  424  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4085  protein of unknown function DUF1501  48.53 
 
 
491 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0673014  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  41.34 
 
 
466 aa  362  9e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  40.68 
 
 
481 aa  347  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2164  protein of unknown function DUF1501  38.82 
 
 
475 aa  341  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0988026  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3132  protein of unknown function DUF1501  41.41 
 
 
482 aa  338  9e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  42.53 
 
 
473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0776  protein of unknown function DUF1501  40.86 
 
 
488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0574  hypothetical protein  40.53 
 
 
483 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  38.59 
 
 
473 aa  325  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1738  protein of unknown function DUF1501  38.82 
 
 
481 aa  308  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  31.98 
 
 
442 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  28.14 
 
 
430 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1150  protein of unknown function DUF1501  29.35 
 
 
479 aa  140  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3972  protein of unknown function DUF1501  26.92 
 
 
465 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1262  protein of unknown function DUF1501  28.29 
 
 
468 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  26.8 
 
 
449 aa  137  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2089  protein of unknown function DUF1501  28.92 
 
 
448 aa  133  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  29.44 
 
 
422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1121  protein of unknown function DUF1501  26.44 
 
 
485 aa  126  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0958  protein of unknown function DUF1501  27.45 
 
 
478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1039  protein of unknown function DUF1501  28.01 
 
 
475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214334  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  27.58 
 
 
432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0523  protein of unknown function DUF1501  25.79 
 
 
439 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  32.17 
 
 
410 aa  53.9  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  30.26 
 
 
387 aa  50.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>